More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0041 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  66.41 
 
 		 533 aa  759    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  60.08 
 
 		 648 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 654 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 516 aa  1060    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 655 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  61.72 
 
 		 632 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 		 653 aa  692    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 		 518 aa  756    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  68.23 
 
 		 651 aa  739    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 653 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 645 aa  669    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  72.39 
 
 		 512 aa  778    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 645 aa  667    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 		 645 aa  683    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  61.09 
 
 		 650 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 660 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 660 aa  615  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 		 659 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 508 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  56.45 
 
 		 660 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 660 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 660 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  56.26 
 
 		 660 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 660 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  56.92 
 
 		 510 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 660 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  56.92 
 
 		 509 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 660 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 660 aa  610  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 509 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 		 509 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 650 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 647 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  53.71 
 
 		 656 aa  591  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 657 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 657 aa  592  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 506 aa  592  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 675 aa  568  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 		 648 aa  560  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 681 aa  535  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 		 654 aa  535  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 634 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 665 aa  531  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 638 aa  529  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 702 aa  523  1e-147  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 		 671 aa  519  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 666 aa  519  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 651 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 664 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 667 aa  512  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 		 647 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 629 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 645 aa  507  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 629 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 675 aa  506  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 530 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 640 aa  499  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 634 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 538 aa  485  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 650 aa  484  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 636 aa  477  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 526 aa  473  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 526 aa  473  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 624 aa  472  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 530 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  44.19 
 
 		 574 aa  462  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 530 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 530 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 644 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 539 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 628 aa  458  1e-127  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 535 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 722 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 523 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 550 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 663 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 642 aa  444  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 657 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 648 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 515 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>