More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0486 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 523 aa  1083    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  70.82 
 
 		 521 aa  781    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  73.98 
 
 		 527 aa  793    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 		 515 aa  623  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  60.59 
 
 		 515 aa  622  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 		 517 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 515 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 511 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 514 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 		 550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 514 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  58.07 
 
 		 514 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 522 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 722 aa  598  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 		 516 aa  591  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 522 aa  594  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  58.4 
 
 		 515 aa  594  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 516 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 659 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 516 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  56.87 
 
 		 522 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 544 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 		 520 aa  591  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0541  methionyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 519 aa  590  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 519 aa  586  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 522 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 		 523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 519 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 		 515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  56.4 
 
 		 525 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 530 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3236  methionyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11026  methionyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 519 aa  568  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.463568  normal  0.948581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6921  methionyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 515 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276994  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 519 aa  569  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  57.5 
 
 		 525 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 519 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 511 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  49.03 
 
 		 574 aa  531  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 512 aa  523  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08580  methionyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 541 aa  525  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 659 aa  487  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 660 aa  485  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 		 660 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 660 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 660 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 660 aa  481  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 660 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 660 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 660 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 660 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 660 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 632 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 645 aa  471  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 648 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 650 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 681 aa  465  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 650 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 511 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 653 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 654 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 653 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 628 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 657 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 657 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 651 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 506 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 656 aa  446  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 655 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 647 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 675 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 535 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 535 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 533 aa  438  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 645 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 702 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 634 aa  433  1e-120  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 665 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 645 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 645 aa  435  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 671 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 629 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 629 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 650 aa  428  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>