More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0972 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
511 aa  1052    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  66.14 
 
 
512 aa  708    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
519 aa  642    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 
517 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
515 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 
515 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 
520 aa  591  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 
544 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  54.64 
 
 
514 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 
550 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  54.47 
 
 
574 aa  579  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 
514 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 
516 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  55.19 
 
 
516 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 
516 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
522 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
659 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
722 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6921  methionyl-tRNA synthetase  57.56 
 
 
515 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 
514 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 
525 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
530 aa  567  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0541  methionyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
519 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
519 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
511 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
519 aa  561  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 
514 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  54.88 
 
 
525 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
522 aa  552  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  51.27 
 
 
506 aa  550  1e-155  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
523 aa  547  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3236  methionyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 
516 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
515 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 
522 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  54.13 
 
 
522 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
515 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
515 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 
509 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
519 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
545 aa  529  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
506 aa  531  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 
510 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
527 aa  528  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
508 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
521 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
509 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
523 aa  520  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  49.32 
 
 
509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11026  methionyl-tRNA synthetase  51.66 
 
 
519 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.463568  normal  0.948581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
509 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 
632 aa  512  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08580  methionyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
541 aa  500  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
511 aa  498  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
654 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
660 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
645 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 
660 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
660 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
660 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
660 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
660 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
660 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
660 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
660 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
660 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
653 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
628 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
648 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
651 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 
659 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
647 aa  473  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
512 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
650 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
653 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 
681 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
650 aa  468  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
656 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
671 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
655 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
657 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
650 aa  460  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
657 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
530 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
546 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
647 aa  455  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 
538 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
634 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
665 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0893  methionyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
503 aa  455  1.0000000000000001e-126  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
634 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 
675 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
638 aa  449  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
645 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
518 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
675 aa  450  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
500 aa  449  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>