More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1990 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 		 522 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 515 aa  756    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  70.12 
 
 		 515 aa  756    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  65.44 
 
 		 550 aa  711    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 530 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  96.51 
 
 		 516 aa  1043    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  68.11 
 
 		 544 aa  719    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  84.11 
 
 		 516 aa  929    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  67.12 
 
 		 722 aa  730    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 516 aa  1074    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 525 aa  645    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 515 aa  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  66.54 
 
 		 514 aa  718    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  62.01 
 
 		 522 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 519 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 		 520 aa  667    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 514 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  69.09 
 
 		 659 aa  732    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  71.51 
 
 		 517 aa  774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  76.62 
 
 		 525 aa  820    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6921  methionyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 515 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  70.55 
 
 		 515 aa  754    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3236  methionyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 		 516 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 		 519 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 		 511 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  60.16 
 
 		 519 aa  664    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 514 aa  734    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 522 aa  634  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 515 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  60.55 
 
 		 514 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 515 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 		 515 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 522 aa  631  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 		 523 aa  628  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0541  methionyl-tRNA synthetase  58.89 
 
 		 519 aa  625  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11026  methionyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 519 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.463568  normal  0.948581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 519 aa  599  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08580  methionyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 541 aa  597  1e-169  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 		 523 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 511 aa  579  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 527 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 		 521 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  51.95 
 
 		 574 aa  568  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 545 aa  501  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 508 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 506 aa  498  1e-139  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 659 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 648 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 632 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 660 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 660 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 660 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 660 aa  482  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 660 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 660 aa  485  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 660 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 660 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  49.12 
 
 		 510 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 660 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 660 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 655 aa  475  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 650 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 511 aa  475  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 650 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 653 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 654 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 518 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 509 aa  465  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 634 aa  465  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 657 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 634 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 650 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 645 aa  458  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 657 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 656 aa  455  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 533 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 538 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 647 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 653 aa  455  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 629 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 629 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 671 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 645 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 628 aa  451  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 651 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0893  methionyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 503 aa  439  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 666 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 681 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 645 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 675 aa  432  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 645 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>