More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1701 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 511 aa  655    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 515 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 530 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 		 515 aa  644    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 519 aa  1064    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  59.41 
 
 		 574 aa  635    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 522 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 517 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  62.38 
 
 		 512 aa  662    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 515 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 550 aa  628  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3236  methionyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 516 aa  628  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 722 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 514 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 514 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 514 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 516 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 520 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 659 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  58.63 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  57.37 
 
 		 516 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 516 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 		 544 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 525 aa  602  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 		 515 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0541  methionyl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 519 aa  599  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 519 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 522 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4266  methionyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 515 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4352  methionyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 515 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0293144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4645  methionyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 		 515 aa  591  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.975298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 523 aa  594  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6921  methionyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 515 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276994  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 519 aa  589  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  55.88 
 
 		 519 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 522 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 522 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 545 aa  580  1e-164  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11026  methionyl-tRNA synthetase  58.71 
 
 		 519 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.463568  normal  0.948581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 		 506 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 525 aa  571  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 523 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 508 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 509 aa  568  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08580  methionyl-tRNA synthetase  54 
 
 		 541 aa  563  1.0000000000000001e-159  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  54.21 
 
 		 509 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 509 aa  559  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 510 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  53.09 
 
 		 521 aa  551  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 506 aa  553  1e-156  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0807  methionyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 		 506 aa  548  1e-155  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 527 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 511 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 632 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 659 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 653 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 645 aa  504  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 660 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 660 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 660 aa  500  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 660 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 653 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 634 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 650 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 647 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 660 aa  498  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 660 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 660 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 654 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 660 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 660 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 660 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 648 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0893  methionyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  48.27 
 
 		 650 aa  488  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 628 aa  485  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 651 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 		 671 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 655 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 665 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 629 aa  474  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 629 aa  474  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 638 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 645 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 666 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 650 aa  468  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 657 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 657 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 645 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 533 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 675 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 656 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 535 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 535 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 530 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 647 aa  455  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>