More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0485 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
660 aa  763    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
660 aa  752    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  56.74 
 
 
656 aa  759    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
660 aa  758    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  81.71 
 
 
665 aa  1131    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
660 aa  752    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
660 aa  753    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
660 aa  752    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
653 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
657 aa  760    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
632 aa  653    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
650 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  59.79 
 
 
675 aa  841    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
660 aa  752    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
648 aa  751    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
655 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
657 aa  760    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 
660 aa  759    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
660 aa  753    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 
659 aa  773    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 
660 aa  752    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
653 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
654 aa  652    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 
666 aa  907    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
675 aa  743    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 
681 aa  793    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
702 aa  792    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
667 aa  1376    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  54.95 
 
 
650 aa  723    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
645 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
645 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
645 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
651 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
648 aa  594  1e-168  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
647 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
638 aa  561  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
645 aa  556  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
654 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
664 aa  551  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
650 aa  547  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
647 aa  543  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
651 aa  541  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
629 aa  535  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
629 aa  535  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
634 aa  526  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
624 aa  527  1e-148  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
518 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
638 aa  525  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
629 aa  515  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 
632 aa  513  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
516 aa  512  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 
636 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
634 aa  507  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
671 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
628 aa  502  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
533 aa  502  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
509 aa  495  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
509 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
510 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
509 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  46.11 
 
 
508 aa  485  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
644 aa  482  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
511 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
642 aa  476  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
506 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
670 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
648 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
663 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
636 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
640 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0187  methionyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
521 aa  459  9.999999999999999e-129  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0035  methionyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
509 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
657 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl036  methionyl-tRNA synthetase  47 
 
 
509 aa  450  1e-125  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
628 aa  452  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 
628 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
519 aa  445  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
628 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
648 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0352  methionyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
545 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338459  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
516 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
512 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  44.34 
 
 
574 aa  435  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
521 aa  436  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
722 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 
544 aa  431  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
500 aa  430  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
538 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
506 aa  432  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
659 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
530 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
511 aa  429  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
519 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
516 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
535 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
536 aa  422  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
526 aa  424  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>