More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04890 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  75.86 
 
 		 526 aa  850    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  79.02 
 
 		 529 aa  869    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 526 aa  1098    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 536 aa  603  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 632 aa  502  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 650 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 653 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 648 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 654 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 655 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 651 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 538 aa  481  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 629 aa  480  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 629 aa  480  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 645 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 541 aa  473  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 638 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 645 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 653 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 518 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 509 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 546 aa  465  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 533 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 650 aa  461  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 647 aa  455  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 647 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 645 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 645 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 659 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 634 aa  451  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 650 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 634 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 539 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 531 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 656 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 665 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 530 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 648 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 660 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 660 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 660 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 660 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 660 aa  438  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 657 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 657 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 651 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 624 aa  434  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1802  methionyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0193813 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 660 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 660 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 533 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 516 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1990  methionyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 516 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.950976  hitchhiker  0.0073495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 671 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 550 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 640 aa  420  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  40.65 
 
 		 574 aa  416  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 525 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0529  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0742332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 517 aa  418  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14741  methionyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0426231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 514 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 681 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 675 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 664 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1534  methionyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6921  methionyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 515 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 722 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10151  methionyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 516 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145983 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0342  methionyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 516 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.190132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 511 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 654 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 523 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 514 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>