More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1806 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 530 aa  782    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  68.05 
 
 		 535 aa  782    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  70.06 
 
 		 530 aa  773    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  65.64 
 
 		 525 aa  733    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  71.4 
 
 		 533 aa  788    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 530 aa  1106    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  67.69 
 
 		 531 aa  766    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  68.05 
 
 		 535 aa  782    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14741  methionyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 515 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0426231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0342  methionyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 516 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.190132  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1334  methionyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 514 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0404003 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10151  methionyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145983 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1140  methionyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.266684  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09951  methionyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09481  methionyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09931  methionyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0902215  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08971  methionyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.931117  decreased coverage  0.000000449236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 632 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0934  methionyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 510 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 509 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 655 aa  475  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 509 aa  475  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 		 653 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 508 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 654 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 509 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 648 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 647 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 651 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 647 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 628 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 650 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 650 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 526 aa  455  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 645 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 650 aa  458  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 629 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 533 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 529 aa  451  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 653 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 634 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 645 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 645 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 665 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 660 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 526 aa  441  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 645 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 634 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 660 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 660 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 660 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 519 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 638 aa  438  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 659 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 530 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 667 aa  430  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  42.64 
 
 		 574 aa  431  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 663 aa  430  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1259  methionyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 527 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0649493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 648 aa  425  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 523 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 722 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 525 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 648 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1000  methionyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 657 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 681 aa  422  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 539 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 538 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 657 aa  420  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 541 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 656 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 514 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 522 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 520 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 512 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 522 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1939  methionyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 521 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 536 aa  410  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 675 aa  410  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>