More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1085 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1085  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 536 aa  1121    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04890  methionyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.733065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 529 aa  594  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 645 aa  484  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 648 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 510 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 632 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 645 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 653 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 650 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 538 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 509 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 629 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 651 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 629 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 653 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 518 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 533 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 650 aa  445  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 634 aa  442  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 675 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 654 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 509 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 671 aa  442  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 645 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 660 aa  435  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 648 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 645 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 647 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 659 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 665 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 638 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 647 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 655 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 660 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 660 aa  435  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 650 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 660 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 634 aa  430  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 660 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 660 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 660 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 660 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 530 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  42.48 
 
 		 574 aa  425  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 667 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 656 aa  422  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5259  methionyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 501 aa  419  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 664 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 657 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 657 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 530 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3992  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 511 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4034  methionyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 535 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.461216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 666 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1806  methionyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000579293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 654 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 681 aa  405  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 533 aa  402  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 519 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 522 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4803  methionyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 511 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 525 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 642 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2158  methionyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 525 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.99655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 517 aa  399  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1930  methionyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 702 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 519 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 516 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 722 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 675 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 636 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 663 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>