More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1459 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 
500 aa  1035    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
510 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
511 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 
632 aa  509  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
508 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
509 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
650 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
647 aa  497  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
648 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
509 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
506 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
628 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
653 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
650 aa  488  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
654 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 
509 aa  485  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
650 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
509 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
493 aa  476  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
660 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
638 aa  472  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
660 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
660 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
660 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
660 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
660 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
660 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
660 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
660 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
660 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
634 aa  467  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
629 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
629 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 
645 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
634 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
518 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
512 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
659 aa  463  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
645 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
655 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
665 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 
645 aa  454  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
653 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
657 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
638 aa  451  1e-125  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
533 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
511 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
512 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
657 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 
656 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
651 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
681 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
645 aa  445  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
666 aa  443  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
647 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3171  methionyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 
530 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
642 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
644 aa  437  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
519 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
675 aa  436  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
624 aa  432  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  41.65 
 
 
574 aa  432  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 
671 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
514 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
667 aa  430  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
648 aa  431  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30340  methionyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
546 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20854  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
522 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
515 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2731  methionyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
541 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.299776  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
632 aa  426  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3113  methionyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
520 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
515 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4858  methionyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
533 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000526962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0095  methionyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
530 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141479 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
515 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
517 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
522 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3334  methionyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
531 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178326  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
523 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2723  methionyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
530 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.148224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
514 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
629 aa  421  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0175  methionyl-tRNA synthetase  41 
 
 
539 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.7084 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
636 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4703  methionyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
522 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
515 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1142  methionyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
525 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.873399  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
525 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
659 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07450  methionyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
526 aa  415  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.988423 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
675 aa  414  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
519 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4558  methionyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
522 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.118201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
722 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1957  methionyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
538 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2661  methionyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
529 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.539364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
544 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0820  methionyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
519 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0770055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>