48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0146 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  453  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  35.15 
 
 
178 aa  59.7  3e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0341  putative lipoprotein  39.67 
 
 
122 aa  58.5  7e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.615172  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2696  signal peptide protein  35.29 
 
 
167 aa  56.2  4e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  35.44 
 
 
325 aa  55.5  6e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  27.62 
 
 
173 aa  55.8  6e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  32.97 
 
 
177 aa  54.7  1e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  34.87 
 
 
331 aa  54.3  1e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  31.08 
 
 
156 aa  55.1  1e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1272  Spore coat U domain protein  33.59 
 
 
175 aa  54.3  1e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  37.04 
 
 
344 aa  54.3  2e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  29.81 
 
 
184 aa  53.1  4e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  26.67 
 
 
181 aa  52  7e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1920  Spore coat U domain protein  29.25 
 
 
342 aa  52  8e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  34.21 
 
 
331 aa  51.2  1e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  34.91 
 
 
177 aa  50.8  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2060  hypothetical protein  34.5 
 
 
147 aa  50.1  3e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.52918e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  31.67 
 
 
181 aa  50.1  3e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  31.71 
 
 
178 aa  49.3  4e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  30.54 
 
 
165 aa  48.9  7e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2695  signal peptide protein  35 
 
 
167 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  29.44 
 
 
167 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  31.43 
 
 
177 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  34.69 
 
 
154 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  35.83 
 
 
182 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  34.69 
 
 
154 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  29.28 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  29.28 
 
 
194 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  31.43 
 
 
177 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3602  spore coat U  31.58 
 
 
165 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  33.94 
 
 
182 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  30.6 
 
 
339 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1064  spore coat protein  30.32 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1071  pilus biogenesis protein  30.32 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1223  spore coat protein U precursor  30.32 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  32.95 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2994  hypothetical protein  30.32 
 
 
164 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2291  hypothetical protein  30.32 
 
 
164 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  31.73 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  36.78 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1605  hypothetical protein  30.32 
 
 
164 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  26.38 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  29.33 
 
 
153 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  27.78 
 
 
176 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  26.79 
 
 
167 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  36.78 
 
 
164 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  28.22 
 
 
163 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  28.22 
 
 
163 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>