More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1800 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
357 aa  717    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.82 
 
 
376 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.21 
 
 
355 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.93 
 
 
355 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.82 
 
 
359 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.97 
 
 
357 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.69 
 
 
357 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.16 
 
 
357 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.31 
 
 
355 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.19 
 
 
355 aa  362  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.35 
 
 
355 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.88 
 
 
355 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.31 
 
 
364 aa  355  5e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.91 
 
 
355 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.03 
 
 
357 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
356 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  47.9 
 
 
358 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.75 
 
 
355 aa  348  8e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
358 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.2 
 
 
354 aa  346  3e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.38 
 
 
357 aa  345  6e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.82 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.9 
 
 
357 aa  339  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.26 
 
 
358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.38 
 
 
355 aa  338  7e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.29 
 
 
357 aa  338  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.63 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  44.38 
 
 
355 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  44.38 
 
 
355 aa  328  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.98 
 
 
358 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.82 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.42 
 
 
356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.04 
 
 
344 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.9 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.31 
 
 
355 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.3 
 
 
349 aa  288  8e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.44 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.54 
 
 
353 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.33 
 
 
351 aa  270  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.28 
 
 
353 aa  212  7e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.67 
 
 
397 aa  209  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
400 aa  208  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  30.42 
 
 
365 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.32 
 
 
405 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.41 
 
 
320 aa  203  4e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.21 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  36.66 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.29 
 
 
396 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  33.72 
 
 
399 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  35.33 
 
 
392 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  34.29 
 
 
399 aa  186  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  34.16 
 
 
325 aa  186  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  38.82 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  38.82 
 
 
411 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  34.44 
 
 
325 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  34.63 
 
 
405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  37.54 
 
 
414 aa  179  8e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.5 
 
 
245 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  38.53 
 
 
411 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.5 
 
 
245 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  36.5 
 
 
411 aa  176  7e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.06 
 
 
245 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.06 
 
 
245 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.06 
 
 
245 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  35.06 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  34.32 
 
 
257 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  32.65 
 
 
399 aa  172  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.63 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.63 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.78 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  34.92 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.63 
 
 
245 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.25 
 
 
240 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  33.72 
 
 
392 aa  169  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
245 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
243 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  31.96 
 
 
325 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  36.8 
 
 
244 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  33.23 
 
 
387 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  31.96 
 
 
325 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.44 
 
 
300 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  31.56 
 
 
401 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.88 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  32.73 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
326 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38 
 
 
294 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  34.94 
 
 
253 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  33.92 
 
 
399 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  31.83 
 
 
393 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  37.39 
 
 
235 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  34.71 
 
 
239 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  32.45 
 
 
784 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  32.34 
 
 
383 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1540  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.42 
 
 
294 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
328 aa  160  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1570  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.42 
 
 
294 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.74 
 
 
784 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.45 
 
 
294 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>