More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1572 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  100 
 
 		 310 aa  628  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  85.71 
 
 		 311 aa  547  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  84.54 
 
 		 308 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  83.71 
 
 		 311 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  83.71 
 
 		 311 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  83.88 
 
 		 308 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  83.71 
 
 		 311 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  83.39 
 
 		 311 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  67.43 
 
 		 311 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  60.19 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  58.9 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  58.44 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  58.44 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  58.44 
 
 		 314 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  58.12 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  58.12 
 
 		 314 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  58.58 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  58.58 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  58.58 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  59.55 
 
 		 314 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  57.47 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  57.19 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  59.09 
 
 		 338 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  57.14 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  57.79 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  57.79 
 
 		 313 aa  364  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  58.25 
 
 		 317 aa  360  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  55.84 
 
 		 314 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  58.25 
 
 		 313 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  59.42 
 
 		 314 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  53.57 
 
 		 308 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  56.07 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  53.59 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  53.59 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  53.57 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  53.59 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  54.43 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  53.59 
 
 		 306 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  56.07 
 
 		 310 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  52.94 
 
 		 306 aa  342  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  54.9 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  53.27 
 
 		 306 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  56.21 
 
 		 309 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  56.21 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  55.88 
 
 		 309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  53.44 
 
 		 306 aa  338  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  52.94 
 
 		 306 aa  338  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  52.94 
 
 		 306 aa  338  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  52.94 
 
 		 306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  52.94 
 
 		 306 aa  338  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  52.61 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  52.61 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  52.61 
 
 		 306 aa  332  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  51.79 
 
 		 308 aa  332  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  51.31 
 
 		 316 aa  331  8e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  52.12 
 
 		 308 aa  331  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  52.77 
 
 		 306 aa  330  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  51.14 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  56.72 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  51.3 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  50.98 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  52.03 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  51.45 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  49.51 
 
 		 309 aa  315  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  54.64 
 
 		 309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  48.52 
 
 		 310 aa  305  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  48.53 
 
 		 311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 		 312 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  47.35 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  48.25 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  47.93 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  45.87 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  46.58 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  46.96 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  46.96 
 
 		 314 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  48.56 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  38.08 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  37.37 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  37.37 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  37.37 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  38.14 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  37.37 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  37.01 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  38.99 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  38.49 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  37.72 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  35.4 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  35.58 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  35.58 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  35.94 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  38.03 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.83 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  39.93 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  38.39 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  36.48 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  35.23 
 
 		 308 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  37.18 
 
 		 321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  36.86 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  35.05 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  36.86 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>