More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1143 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  45.2 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  47.49 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3191  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.7 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5033  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.7 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  32.53 
 
 		 933 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00030  cysteine-type peptidase, putative  31.72 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.2 
 
 		 231 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  34.4 
 
 		 231 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32 
 
 		 231 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3683  ThiJ/PfpI domain protein  33.2 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1896  ThiJ/PfpI domain protein  31.64 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.815712  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  32.81 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  32.81 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.8 
 
 		 233 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  30.04 
 
 		 224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.47 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  32.94 
 
 		 231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  33.07 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.6 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  32.67 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  32.67 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  32.67 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  32.67 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  32.67 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  32.67 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  32.67 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.08 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  33.99 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  30.28 
 
 		 223 aa  109  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  31.35 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.62 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.62 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  32.02 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.76 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.62 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  32.4 
 
 		 225 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  31.62 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  30.23 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  32.27 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  32.41 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  30.4 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1831  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.38 
 
 		 233 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  29.63 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  29.64 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.8 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  31.93 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  30.92 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.66 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  30.4 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25350  putative intracellular protease/amidase  31.2 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.49 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.47 
 
 		 225 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  30.4 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  30.74 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  30.64 
 
 		 228 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.64 
 
 		 228 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  30.8 
 
 		 225 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.91 
 
 		 228 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  31.75 
 
 		 257 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  30 
 
 		 227 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.91 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  30.08 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  28.29 
 
 		 225 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  29.92 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  27.89 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.76 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2968  chaperone protein HchA  27.2 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 226 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  31.2 
 
 		 225 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  27.66 
 
 		 224 aa  95.9  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  29.66 
 
 		 233 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  28.57 
 
 		 234 aa  95.5  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  30 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.64 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.37 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  26.98 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  30.95 
 
 		 229 aa  92.8  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  29.32 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.44 
 
 		 242 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  26.85 
 
 		 226 aa  92.4  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.69 
 
 		 224 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  29.41 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  30.71 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.26 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  31.43 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  29.83 
 
 		 233 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.46 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  29.6 
 
 		 227 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  24.68 
 
 		 223 aa  89.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 233 aa  89.4  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.63 
 
 		 225 aa  89  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  30.12 
 
 		 237 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.04 
 
 		 227 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  30.8 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  27.84 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.6 
 
 		 228 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  25.42 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>