More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3700 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  460  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  97.81 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  95.61 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  94.76 
 
 		 228 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  94.3 
 
 		 228 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  94.3 
 
 		 228 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  93.86 
 
 		 228 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  81.33 
 
 		 227 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  80.44 
 
 		 226 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  80.44 
 
 		 226 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  80.44 
 
 		 226 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  80.44 
 
 		 226 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  80.44 
 
 		 226 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  80.44 
 
 		 226 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  80.44 
 
 		 226 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  72.89 
 
 		 245 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  71.11 
 
 		 226 aa  330  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  70.67 
 
 		 225 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  71.24 
 
 		 230 aa  321  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.74 
 
 		 228 aa  317  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  70.22 
 
 		 227 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.78 
 
 		 227 aa  309  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  68.44 
 
 		 225 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.56 
 
 		 225 aa  308  5e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  64.47 
 
 		 230 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  64.91 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.44 
 
 		 230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  70.37 
 
 		 229 aa  305  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  67.57 
 
 		 232 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  70.18 
 
 		 227 aa  305  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  64.89 
 
 		 225 aa  305  5.0000000000000004e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  66.22 
 
 		 227 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  64.89 
 
 		 225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.27 
 
 		 229 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  66.37 
 
 		 225 aa  300  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  68.02 
 
 		 230 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  64.89 
 
 		 225 aa  299  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.64 
 
 		 228 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.22 
 
 		 224 aa  298  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  65.78 
 
 		 225 aa  297  7e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64 
 
 		 230 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64 
 
 		 232 aa  297  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64 
 
 		 230 aa  297  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.11 
 
 		 227 aa  296  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  66.22 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  64 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.22 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  62.22 
 
 		 226 aa  295  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  66.67 
 
 		 225 aa  294  9e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  63.44 
 
 		 231 aa  291  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  65.18 
 
 		 227 aa  291  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.44 
 
 		 230 aa  291  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64 
 
 		 225 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.62 
 
 		 225 aa  289  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.79 
 
 		 231 aa  288  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  64.44 
 
 		 225 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  65.49 
 
 		 227 aa  286  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  62.22 
 
 		 233 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  59.11 
 
 		 267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  69.33 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  64.49 
 
 		 229 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.71 
 
 		 224 aa  281  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  67.11 
 
 		 225 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  65.24 
 
 		 226 aa  275  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  61.5 
 
 		 227 aa  274  7e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  65.24 
 
 		 233 aa  274  8e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  60.09 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  58.22 
 
 		 229 aa  271  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  59.21 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  54.02 
 
 		 230 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  54.02 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  48.89 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.68 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  52.44 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.11 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  46.9 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.56 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  45.98 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  49.14 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  44.64 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.86 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  46.02 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  40.97 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.27 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  43.3 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.02 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.86 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  43.56 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  39.65 
 
 		 221 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  43.89 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  44.6 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  40.09 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  40.34 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  43.44 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  43.44 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.34 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  41.28 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  42.86 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  39.3 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  42.53 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>