More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3545 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  88.89 
 
 		 227 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  77.23 
 
 		 225 aa  360  9e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  75.78 
 
 		 232 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  73.78 
 
 		 225 aa  332  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  74.89 
 
 		 226 aa  331  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.89 
 
 		 230 aa  328  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.89 
 
 		 232 aa  328  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.89 
 
 		 230 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.78 
 
 		 225 aa  327  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  70.98 
 
 		 225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.44 
 
 		 230 aa  325  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  71.88 
 
 		 230 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  71.56 
 
 		 225 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  68 
 
 		 230 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  70.98 
 
 		 224 aa  322  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  75.12 
 
 		 229 aa  322  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  70.09 
 
 		 245 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  71.11 
 
 		 228 aa  319  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.64 
 
 		 225 aa  317  7e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  70.59 
 
 		 230 aa  317  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  65.18 
 
 		 267 aa  317  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.2 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  69.2 
 
 		 227 aa  317  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  70.54 
 
 		 227 aa  316  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.07 
 
 		 225 aa  315  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  68.89 
 
 		 225 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  67.87 
 
 		 225 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  67.86 
 
 		 226 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  66.97 
 
 		 225 aa  311  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.44 
 
 		 225 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  70.09 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  67.71 
 
 		 224 aa  308  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  68.3 
 
 		 226 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  68.3 
 
 		 226 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  69.33 
 
 		 225 aa  308  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  68.3 
 
 		 226 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  68.3 
 
 		 226 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  68.3 
 
 		 226 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  68.3 
 
 		 226 aa  308  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  68.3 
 
 		 226 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.75 
 
 		 227 aa  307  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  70.67 
 
 		 227 aa  305  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  67.41 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  63.39 
 
 		 230 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  65.62 
 
 		 225 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  63.84 
 
 		 230 aa  300  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  67.26 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  64.73 
 
 		 227 aa  297  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.05 
 
 		 231 aa  296  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  66.2 
 
 		 229 aa  295  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  63.11 
 
 		 233 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.67 
 
 		 228 aa  294  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  66.22 
 
 		 228 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  63.84 
 
 		 231 aa  292  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.05 
 
 		 227 aa  292  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.52 
 
 		 228 aa  291  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  65.49 
 
 		 227 aa  290  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  69.2 
 
 		 229 aa  289  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  61.61 
 
 		 229 aa  288  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  62.33 
 
 		 227 aa  285  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  59.82 
 
 		 229 aa  285  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  66.03 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  65.07 
 
 		 233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.05 
 
 		 228 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  68.57 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.57 
 
 		 228 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  56.44 
 
 		 246 aa  266  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  59.64 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  54.91 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  54.46 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.79 
 
 		 242 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  48 
 
 		 257 aa  225  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.79 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  46.67 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.77 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  51.79 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  47.53 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  43.95 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  46.64 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.67 
 
 		 238 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  42.6 
 
 		 221 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  43.95 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  43.5 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  41.05 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  42.92 
 
 		 237 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  40.18 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.61 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.26 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  42.6 
 
 		 224 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  41.07 
 
 		 227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.41 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  42.79 
 
 		 234 aa  157  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  38.71 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2524  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.71 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.61 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  39.55 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  40.53 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  37.89 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  39.55 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>