245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0116 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  56.76 
 
 
230 aa  263  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.78 
 
 
234 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.3 
 
 
232 aa  241  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  52.47 
 
 
226 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.23 
 
 
258 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  50.23 
 
 
227 aa  221  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.98 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  48.65 
 
 
224 aa  215  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.98 
 
 
237 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.09 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  45.21 
 
 
223 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.67 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  43.64 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  43.64 
 
 
230 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  41.59 
 
 
230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  42.04 
 
 
230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  46.53 
 
 
261 aa  191  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  40.53 
 
 
229 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  40.81 
 
 
229 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  40.36 
 
 
227 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  40.09 
 
 
227 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  44.29 
 
 
224 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  40.53 
 
 
229 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.77 
 
 
242 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  40.36 
 
 
227 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  40.36 
 
 
227 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  42.73 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.44 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  45.05 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  41.7 
 
 
221 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.36 
 
 
230 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.96 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.12 
 
 
227 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  41.41 
 
 
225 aa  177  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.96 
 
 
232 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.96 
 
 
230 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  38.96 
 
 
230 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  38.36 
 
 
230 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.11 
 
 
228 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  39.01 
 
 
267 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.53 
 
 
230 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  41.3 
 
 
225 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  41.78 
 
 
227 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.23 
 
 
224 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  39.08 
 
 
233 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  41.55 
 
 
229 aa  175  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.26 
 
 
224 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.71 
 
 
225 aa  175  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.27 
 
 
227 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.79 
 
 
232 aa  174  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.4 
 
 
209 aa  174  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  40.69 
 
 
260 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.69 
 
 
260 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  41.05 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.18 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.91 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.46 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  38.63 
 
 
250 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  37.67 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  39.91 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  39.73 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  40.34 
 
 
225 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  39.66 
 
 
225 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  39.19 
 
 
228 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  37.83 
 
 
225 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  39.3 
 
 
245 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  39.21 
 
 
227 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  40.44 
 
 
226 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  38.84 
 
 
227 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.22 
 
 
229 aa  168  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.86 
 
 
228 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.99 
 
 
223 aa  168  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  41.38 
 
 
227 aa  167  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.39 
 
 
225 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  35.78 
 
 
230 aa  167  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  39.73 
 
 
219 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  41.41 
 
 
226 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2524  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.47 
 
 
234 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  40.18 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  39.11 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.64 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  37.12 
 
 
226 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  39.39 
 
 
235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  38.97 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  38.66 
 
 
230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  39.91 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  40.6 
 
 
226 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  40.6 
 
 
226 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  40.6 
 
 
226 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  40.6 
 
 
226 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  40.6 
 
 
226 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  40.6 
 
 
226 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  40.6 
 
 
226 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  38.86 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  38.84 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  37.95 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  39.91 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  38.26 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  39.09 
 
 
227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>