More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1380 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.98 
 
 		 229 aa  258  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  51.25 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  53.78 
 
 		 225 aa  248  6e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  53.33 
 
 		 225 aa  246  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.44 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  50.44 
 
 		 229 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  50.44 
 
 		 227 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  49.58 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.92 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.34 
 
 		 230 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  49.34 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.91 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  51.58 
 
 		 227 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.91 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  51.58 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  51.58 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  51.58 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  51.58 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  51.58 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  51.58 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  51.58 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  49.56 
 
 		 227 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.22 
 
 		 230 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  52.11 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  48 
 
 		 226 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.23 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.33 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.77 
 
 		 225 aa  229  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  49.33 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  48.89 
 
 		 227 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  50.23 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  48.25 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.42 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  49.78 
 
 		 233 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  48 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.66 
 
 		 227 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.68 
 
 		 224 aa  224  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  49.33 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  47.77 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.44 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.89 
 
 		 228 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.89 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.87 
 
 		 224 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  46.43 
 
 		 227 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.37 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  46.43 
 
 		 226 aa  219  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  46.67 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  50 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  49.56 
 
 		 230 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  46.61 
 
 		 232 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.9 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.05 
 
 		 228 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  45.09 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  45.37 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.05 
 
 		 227 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  47.51 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  46.22 
 
 		 246 aa  208  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  47.85 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  47.85 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.57 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  44.93 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  44.8 
 
 		 225 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.12 
 
 		 228 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  47.56 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  48.68 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.68 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  43.75 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.23 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  42.92 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  44.69 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  44.69 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  46.7 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  42.29 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.59 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  43.3 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  42.22 
 
 		 221 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  40 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  43.04 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  37.61 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.61 
 
 		 231 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  38.67 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  39.65 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.96 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  37.99 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  37.83 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  41.53 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  36.84 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  36.56 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  35.96 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.56 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  38.26 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  38.26 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  37.72 
 
 		 230 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  34.23 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  38.22 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  37.89 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  38.22 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  37.78 
 
 		 220 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.07 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0569087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>