More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00734 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  64.79 
 
 
229 aa  282  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  61.26 
 
 
226 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  61.71 
 
 
227 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  61.43 
 
 
225 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  61.71 
 
 
226 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  61.71 
 
 
226 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  61.71 
 
 
226 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  61.71 
 
 
226 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  61.71 
 
 
226 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  61.71 
 
 
226 aa  275  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  61.71 
 
 
226 aa  275  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  60.27 
 
 
228 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.09 
 
 
228 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.09 
 
 
228 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.05 
 
 
229 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  59.64 
 
 
230 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  58.11 
 
 
227 aa  271  6e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  59.91 
 
 
225 aa  271  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  56.05 
 
 
229 aa  270  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.76 
 
 
225 aa  268  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  59.38 
 
 
227 aa  268  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  60.54 
 
 
227 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  59.64 
 
 
225 aa  265  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  59.36 
 
 
225 aa  265  4e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  56.95 
 
 
230 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.71 
 
 
231 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.95 
 
 
232 aa  264  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.95 
 
 
230 aa  264  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  58.45 
 
 
225 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.5 
 
 
230 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  57.92 
 
 
232 aa  262  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.95 
 
 
230 aa  262  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.4 
 
 
228 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  55.41 
 
 
267 aa  259  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.5 
 
 
228 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  56.76 
 
 
227 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  55.45 
 
 
225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.81 
 
 
227 aa  256  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  54.05 
 
 
226 aa  255  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  55.61 
 
 
225 aa  255  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  56.95 
 
 
225 aa  255  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.8 
 
 
227 aa  254  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  54.71 
 
 
225 aa  254  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  55.16 
 
 
227 aa  254  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  58.3 
 
 
224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  57.21 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  52.7 
 
 
230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  55.16 
 
 
225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.62 
 
 
228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  56.5 
 
 
233 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  54.26 
 
 
225 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.95 
 
 
230 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.58 
 
 
228 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  56.05 
 
 
227 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.6 
 
 
227 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  51.35 
 
 
230 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  60.1 
 
 
228 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.1 
 
 
228 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  52.02 
 
 
246 aa  244  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  55.71 
 
 
230 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.95 
 
 
224 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  56.5 
 
 
225 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.81 
 
 
225 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  55.56 
 
 
226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  54.11 
 
 
233 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  54.98 
 
 
229 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  50.9 
 
 
231 aa  229  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  56.76 
 
 
229 aa  226  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  47.09 
 
 
230 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  47.09 
 
 
230 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  45.37 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  47.85 
 
 
224 aa  206  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  43.95 
 
 
224 aa  188  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.6 
 
 
255 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.37 
 
 
242 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  42.15 
 
 
267 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  41.96 
 
 
223 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.29 
 
 
238 aa  168  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  38.22 
 
 
230 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  40.99 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.23 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  38.29 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.64 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.26 
 
 
237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.33 
 
 
258 aa  161  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  43.16 
 
 
237 aa  160  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  39.65 
 
 
221 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 
237 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  40.81 
 
 
226 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  35.87 
 
 
228 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  38.12 
 
 
226 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.84 
 
 
227 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  37.39 
 
 
250 aa  152  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  38.39 
 
 
229 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.57 
 
 
227 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  38.12 
 
 
220 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  38.53 
 
 
220 aa  148  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  39.21 
 
 
229 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  40.53 
 
 
233 aa  148  8e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>