196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4305 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  77.09 
 
 
235 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  75 
 
 
232 aa  359  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  71.68 
 
 
228 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  70.04 
 
 
260 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  70.04 
 
 
260 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  68.58 
 
 
227 aa  337  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  70.22 
 
 
227 aa  335  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  72.12 
 
 
227 aa  325  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  72.57 
 
 
227 aa  321  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  70.48 
 
 
228 aa  314  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  48.25 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  46.67 
 
 
273 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.73 
 
 
249 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  44.05 
 
 
226 aa  208  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  44.44 
 
 
250 aa  207  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  40.69 
 
 
232 aa  205  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  42.73 
 
 
230 aa  204  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.26 
 
 
227 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  44.49 
 
 
228 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  43.86 
 
 
230 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.05 
 
 
228 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.04 
 
 
228 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  40.97 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  40.53 
 
 
229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  41.44 
 
 
227 aa  181  7e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  41.44 
 
 
227 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  41.44 
 
 
227 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  40.53 
 
 
229 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  40.27 
 
 
227 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  41.07 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  40.97 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  39.91 
 
 
223 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  40.17 
 
 
221 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  36.56 
 
 
257 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  35.37 
 
 
226 aa  157  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 
246 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  40.17 
 
 
221 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  41.7 
 
 
229 aa  155  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  37.17 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  38.77 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.6 
 
 
230 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.23 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 
227 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  38.16 
 
 
230 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.16 
 
 
232 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.16 
 
 
230 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  38.26 
 
 
224 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.28 
 
 
258 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.72 
 
 
230 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  39.51 
 
 
261 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  38.67 
 
 
227 aa  148  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  42.41 
 
 
166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36 
 
 
235 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.48 
 
 
238 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.17 
 
 
229 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.76 
 
 
209 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  36 
 
 
267 aa  141  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  38.39 
 
 
226 aa  141  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.65 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  35.27 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  35.11 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2524  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.57 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  34.21 
 
 
229 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  34.82 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.19 
 
 
227 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  34.22 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  34.96 
 
 
230 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  34.82 
 
 
226 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  33.33 
 
 
230 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  33.62 
 
 
357 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  31.42 
 
 
267 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  33.04 
 
 
223 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  33.48 
 
 
366 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.28 
 
 
237 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.38 
 
 
225 aa  135  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.55 
 
 
227 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.03 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.8 
 
 
228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0621  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.121561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.4 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.6 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.05 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.56 
 
 
225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  38.16 
 
 
225 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  36.4 
 
 
245 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  34.06 
 
 
220 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.59 
 
 
224 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  34.2 
 
 
224 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  35.29 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.16 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.48 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  33.62 
 
 
220 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  33.62 
 
 
220 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  36 
 
 
225 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.11 
 
 
223 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  32.75 
 
 
224 aa  128  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  34.84 
 
 
225 aa  128  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>