230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1679 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
279 aa  568  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  70.25 
 
 
279 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5033  ThiJ/PfpI domain-containing protein  69.64 
 
 
280 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3191  ThiJ/PfpI domain-containing protein  68.57 
 
 
280 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.33 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.505852 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  36.67 
 
 
933 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00030  cysteine-type peptidase, putative  35.21 
 
 
252 aa  149  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3683  ThiJ/PfpI domain protein  37.93 
 
 
232 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  37.4 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.52 
 
 
233 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  35.11 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.64 
 
 
231 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1896  ThiJ/PfpI domain protein  32.05 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.815712  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.2 
 
 
231 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  32.03 
 
 
250 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  32.03 
 
 
250 aa  115  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  30.67 
 
 
223 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  32.3 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25350  putative intracellular protease/amidase  33.33 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  32.03 
 
 
225 aa  109  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  32.68 
 
 
230 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  31.64 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  31.76 
 
 
230 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.64 
 
 
230 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.64 
 
 
232 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.64 
 
 
230 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1831  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.6 
 
 
233 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  31.52 
 
 
227 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  31.91 
 
 
230 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  32.22 
 
 
257 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  31.52 
 
 
267 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 
230 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.3 
 
 
225 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  31.64 
 
 
227 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.47 
 
 
225 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.14 
 
 
227 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  31.52 
 
 
227 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.86 
 
 
224 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  31.78 
 
 
225 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  30.62 
 
 
227 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.13 
 
 
228 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  31.91 
 
 
227 aa  99.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  31.25 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  28.9 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  31.37 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  31.64 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.12 
 
 
229 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  31.64 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  31.64 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  31.64 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  31.64 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  31.64 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  31.64 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  32.95 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  31.33 
 
 
229 aa  96.7  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  31.42 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.54 
 
 
228 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  32.55 
 
 
228 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.04 
 
 
238 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  29.06 
 
 
232 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  29.79 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.92 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.23 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.52 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  30.34 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  30.77 
 
 
233 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  27.35 
 
 
224 aa  93.2  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  32.34 
 
 
237 aa  92.4  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  26.27 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  29.8 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  30.47 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  31.06 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  31.4 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  30.92 
 
 
230 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  27.84 
 
 
225 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  30.7 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.15 
 
 
227 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  29.34 
 
 
225 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.02 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.85 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  30.74 
 
 
225 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  29.41 
 
 
227 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  31.66 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  27.23 
 
 
219 aa  89  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  31.54 
 
 
224 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  29.69 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.3 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  30.53 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.8 
 
 
228 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.8 
 
 
230 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  30.6 
 
 
231 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.52 
 
 
231 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  31.36 
 
 
228 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  30.08 
 
 
226 aa  86.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.41 
 
 
228 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.09 
 
 
234 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  30.29 
 
 
229 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  29.41 
 
 
228 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  27.44 
 
 
224 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  31.22 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>