More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3900 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3683  ThiJ/PfpI domain protein  81.9 
 
 		 232 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1831  ThiJ/PfpI domain-containing protein  63.8 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  52.59 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  47.21 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.19 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.48 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25350  putative intracellular protease/amidase  46.98 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  43.29 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  40.26 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  39.39 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  37.77 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  37.77 
 
 		 250 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.59 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23380  putative intracellular protease/amidase  40 
 
 		 243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  40.34 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  37.23 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  37.66 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3191  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.02 
 
 		 280 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  41.12 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.7 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5033  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.02 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  38.43 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.22 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  35.06 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  38.1 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.37 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  37.66 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  35.93 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.76 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.86 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  35.32 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  40.85 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  35.38 
 
 		 279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.62 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.35 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  35.52 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 226 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  34.48 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  36.96 
 
 		 267 aa  131  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  34.73 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  36.8 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  36.73 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  37.55 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.18 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  38.07 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.55 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  37.77 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.17 
 
 		 230 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  36.28 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.17 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.17 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  37.87 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  36.11 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  34.5 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  36.17 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.37 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.29 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  35.62 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.55 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  37.12 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  36.68 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.5 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  34.06 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  36.36 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  36.36 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.47 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.9 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  36.11 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  37.05 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  35.65 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  34.89 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  33.62 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  32.48 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  34.47 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  35.59 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  35.53 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.91 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  33.61 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  38.43 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.8 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  39.53 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  36.49 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  33.77 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  34.93 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  30.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  35.34 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  30.04 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.75 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  30.04 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.33 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  35.34 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  31.9 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  33.76 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>