More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1568 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  100 
 
 
638 aa  1311    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  31.84 
 
 
495 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  31.7 
 
 
519 aa  223  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  32.85 
 
 
627 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  31.71 
 
 
470 aa  218  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  29.4 
 
 
517 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  31.77 
 
 
491 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.55 
 
 
500 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.82 
 
 
472 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  30.47 
 
 
479 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.59 
 
 
501 aa  188  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  28.27 
 
 
480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.18 
 
 
462 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  29.23 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  30.39 
 
 
487 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.8 
 
 
497 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  29.68 
 
 
490 aa  180  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  28.9 
 
 
486 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.59 
 
 
497 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.59 
 
 
497 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.59 
 
 
497 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  29.93 
 
 
462 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  26.83 
 
 
539 aa  177  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  28.36 
 
 
631 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.3 
 
 
497 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  28.73 
 
 
457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.69 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.45 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.34 
 
 
497 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  31.89 
 
 
467 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  29.52 
 
 
471 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  29.51 
 
 
481 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.02 
 
 
497 aa  171  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  28.75 
 
 
506 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  29.62 
 
 
453 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  28.31 
 
 
543 aa  167  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  32.79 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.39 
 
 
458 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  30.31 
 
 
474 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.92 
 
 
491 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.49 
 
 
471 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  28.95 
 
 
488 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  31.91 
 
 
453 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.07 
 
 
460 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.5 
 
 
482 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  28.36 
 
 
500 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  30 
 
 
546 aa  158  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.97 
 
 
468 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  28.25 
 
 
470 aa  158  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  32.14 
 
 
505 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  31.87 
 
 
505 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  27.57 
 
 
481 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  30.39 
 
 
483 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  28.36 
 
 
609 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.39 
 
 
523 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  27.27 
 
 
553 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  27.89 
 
 
543 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  28.93 
 
 
486 aa  150  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  32.22 
 
 
526 aa  150  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  27.7 
 
 
536 aa  150  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  28.17 
 
 
510 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  27.31 
 
 
551 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  32.29 
 
 
544 aa  148  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  27.68 
 
 
457 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  27.59 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  31.61 
 
 
515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  29.61 
 
 
489 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  29.05 
 
 
482 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  28.98 
 
 
478 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  26 
 
 
480 aa  146  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  28.86 
 
 
500 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  30.73 
 
 
525 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  31.17 
 
 
545 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  31.94 
 
 
557 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  30.46 
 
 
542 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  26.47 
 
 
442 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  32.07 
 
 
579 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.44 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  32.06 
 
 
510 aa  143  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  31.65 
 
 
547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  31.4 
 
 
552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  30.96 
 
 
522 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  27.79 
 
 
506 aa  142  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  32.07 
 
 
567 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.33 
 
 
548 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  31.46 
 
 
440 aa  141  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  27.88 
 
 
438 aa  140  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  27.29 
 
 
492 aa  140  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  28.18 
 
 
457 aa  140  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  30.89 
 
 
554 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  29.95 
 
 
513 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  27.59 
 
 
470 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  27.66 
 
 
637 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  30.83 
 
 
548 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  26.34 
 
 
553 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  30.52 
 
 
508 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  30.39 
 
 
502 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  29.23 
 
 
524 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  28.54 
 
 
459 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  26.97 
 
 
493 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>