236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1962 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  100 
 
 		 240 aa  474  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  49.09 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  44.64 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  45.5 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  39.11 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  39.81 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  41.85 
 
 		 244 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  36.33 
 
 		 246 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  38.76 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  38.76 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  36.96 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  37.32 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  35.71 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  40.27 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  36.21 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  36.05 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  38.24 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  37.82 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  36.32 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  40 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  37.12 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  33.49 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  37.89 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.74 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  35.62 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  35.19 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  30.84 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  29.07 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  35.71 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  29.91 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  32.92 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  30.51 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  32.92 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  27.5 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  33.33 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  30.23 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  33.48 
 
 		 292 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  33.18 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  29.58 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  29.58 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  29.58 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  31.19 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  33.15 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  31.25 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  31.19 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  31.19 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  31.19 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  31.19 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  31.19 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  31.19 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  31.19 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  28.88 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  29.65 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.22 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  29.46 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  35.2 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  35.2 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  35.2 
 
 		 249 aa  95.1  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  29.86 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  31.25 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  27.19 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  29.02 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  31.37 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  29.49 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  30.56 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  29.82 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  27.47 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  29.19 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  29.24 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  25.22 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  29.7 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  28.63 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  28.11 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  28.51 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  28.27 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  27.59 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  28.7 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  28.82 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  30.11 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  27.73 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  27.5 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  28.38 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.5 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  28.76 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  28.15 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  28.33 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  30.08 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  28.21 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  27.23 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  31.35 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  27.03 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  31.03 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  25.53 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  27.54 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  30.4 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  27.43 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  32.39 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  30.4 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>