More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3588 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3588  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
392 aa  766    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3587  flagellin domain-containing protein  89.37 
 
 
345 aa  363  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3589  flagellin domain-containing protein  87.11 
 
 
341 aa  333  4e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  63.89 
 
 
281 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  59.9 
 
 
289 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  39.23 
 
 
387 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  36.18 
 
 
379 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  36.67 
 
 
384 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  38.66 
 
 
394 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  38.13 
 
 
393 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  36.61 
 
 
377 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  36.86 
 
 
377 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  35.7 
 
 
384 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  36.5 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  34.99 
 
 
377 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  34.99 
 
 
377 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  34.66 
 
 
376 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  34.17 
 
 
378 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  36.82 
 
 
377 aa  193  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  35.09 
 
 
402 aa  193  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  34.17 
 
 
378 aa  192  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  35.71 
 
 
375 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  34.61 
 
 
376 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  36.32 
 
 
377 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  34.47 
 
 
376 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  34.58 
 
 
383 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  33.08 
 
 
387 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  50.83 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  34.09 
 
 
380 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  32.26 
 
 
385 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  32.08 
 
 
387 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  55.42 
 
 
484 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  33.1 
 
 
405 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  33.33 
 
 
319 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  32.83 
 
 
391 aa  167  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  54.82 
 
 
485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  32.18 
 
 
420 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  32.91 
 
 
319 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  42.75 
 
 
272 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  32.58 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  32.74 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  34.47 
 
 
392 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  31.65 
 
 
404 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  33.16 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  33.5 
 
 
395 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  33.58 
 
 
390 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  33.07 
 
 
372 aa  162  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  33.18 
 
 
404 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  36.39 
 
 
404 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  50.79 
 
 
516 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3456  flagellin domain-containing protein  41.35 
 
 
267 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  47.2 
 
 
270 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3639  flagellin-like protein  46.27 
 
 
266 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  51.67 
 
 
467 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  40.75 
 
 
267 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  51.81 
 
 
488 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4651  flagellin domain-containing protein  44.55 
 
 
303 aa  156  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708723  normal  0.498998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  34.65 
 
 
386 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
268 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.1 
 
 
276 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  32.05 
 
 
386 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  51.81 
 
 
492 aa  152  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  31.13 
 
 
462 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3959  flagellin domain-containing protein  49.1 
 
 
270 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  33.25 
 
 
369 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  33.25 
 
 
369 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  33.58 
 
 
398 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  51.2 
 
 
468 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  52.9 
 
 
377 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  52.9 
 
 
377 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  47.59 
 
 
271 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  30.79 
 
 
356 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  43.09 
 
 
296 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  48.81 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  45.41 
 
 
264 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  34.92 
 
 
385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  47.59 
 
 
270 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  48.17 
 
 
517 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  32.75 
 
 
390 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  32.75 
 
 
390 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  52.15 
 
 
494 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  48.8 
 
 
272 aa  146  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0199  flagellin  45.35 
 
 
296 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  46.71 
 
 
275 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  50.31 
 
 
687 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3358  flagellin domain-containing protein  45.7 
 
 
304 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0276  lateral flagellar flagellin LafA  45.7 
 
 
304 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0420312  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  31.93 
 
 
379 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  48.19 
 
 
273 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.41 
 
 
280 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  46.71 
 
 
275 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  49.4 
 
 
272 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  46.96 
 
 
272 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  47.9 
 
 
271 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  47.9 
 
 
271 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  44.33 
 
 
272 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  44.33 
 
 
272 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  53.21 
 
 
377 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  47.59 
 
 
272 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  46.82 
 
 
274 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>