More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0113 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0113  translation elongation factor Ts  100 
 
 		 279 aa  557  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00747811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3036  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  59.86 
 
 		 278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00138132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0883  translation elongation factor Ts  58.24 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4744  translation elongation factor Ts  59.27 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000848801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3494  translation elongation factor Ts  58.91 
 
 		 278 aa  301  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000803049  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0049  translation elongation factor Ts  53.09 
 
 		 277 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0008  translation elongation factor Ts  49.64 
 
 		 276 aa  266  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0378  elongation factor Ts  46.55 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04070  elongation factor Ts  44.75 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0724  translation elongation factor Ts  44.86 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2012  elongation factor Ts  44.44 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.895136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1809  elongation factor Ts  44.25 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.864602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0425  elongation factor Ts  45.99 
 
 		 288 aa  224  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.141964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1647  elongation factor Ts  45.26 
 
 		 288 aa  222  4e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2352  elongation factor Ts  45.45 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000872397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08140  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  44.52 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.104482  hitchhiker  0.0000000435268 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12260  translation elongation factor Ts  47.22 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000728312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  43.64 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1609  translation elongation factor Ts  40.98 
 
 		 320 aa  214  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00132099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3990  translation elongation factor Ts  41.67 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2009  elongation factor Ts  43.01 
 
 		 288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.974117  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1416  translation elongation factor Ts  43.17 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0238  translation elongation factor Ts  44.09 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  43.62 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3409  translation elongation factor Ts  43.37 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  43.62 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0404  elongation factor Ts  42.31 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  43.4 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2199  translation elongation factor Ts  45.32 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  40.73 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1368  elongation factor Ts  42.81 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0623033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  43.12 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1275  elongation factor Ts  42.45 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0677  elongation factor Ts  44.24 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0729011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  45.85 
 
 		 294 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  45.49 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0995  translation elongation factor Ts  41.01 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.219767  normal  0.401894 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  42.09 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1385  elongation factor Ts  41.37 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000279942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  43.07 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1864  elongation factor Ts  43.17 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1529  elongation factor Ts  43.27 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000439027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1450  elongation factor Ts  44.98 
 
 		 294 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1541  elongation factor Ts  43.53 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.34519 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23600  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  42.14 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13025 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06750  elongation factor Ts  40.79 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00748724  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  40.51 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09900  elongation factor Ts  43.88 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0808  translation elongation factor Ts  40 
 
 		 283 aa  193  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0508  elongation factor Ts  44.07 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0459419  normal  0.717587 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1104  translation elongation factor Ts  42.2 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000532403  unclonable  0.00000000000000104314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11200  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  41.64 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5910  translation elongation factor Ts  44 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0273949  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1323  elongation factor Ts  43.97 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  39.71 
 
 		 294 aa  191  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  40.73 
 
 		 290 aa  191  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  43.32 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  43.32 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0673  translation elongation factor Ts  42.32 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3256  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1530  elongation factor Ts  40.5 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0476362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  43.32 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1231  elongation factor Ts  42.91 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0442239  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  44.14 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2051  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1920  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.305981 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2377  translation elongation factor Ts  40.5 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2038  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.743744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5328  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111187  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6059  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.986017  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2018  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  42.09 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  42.96 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  43.75 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  43.32 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  39.86 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  38.87 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0786  elongation factor Ts  42.01 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1436  elongation factor Ts  42.34 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  40.66 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  41.24 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  42.6 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  43.36 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  41.82 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  42.58 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>