More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2019 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 363 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  60.73 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.42 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 		 398 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  36.15 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.11 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.9 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 		 750 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 361 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  32.36 
 
 		 413 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  31.4 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  30.69 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.76 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 1177 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  37.59 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 739 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.52 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 1177 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.77 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  24.64 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  29.04 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  24.64 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  28.15 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  30.26 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  23.93 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 403 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  36.53 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 		 412 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.32 
 
 		 745 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 350 aa  97.8  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 468 aa  97.1  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02227  hypothetical protein  32.06 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 381 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  34.09 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 		 890 aa  96.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 376 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  33.01 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.5 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>