132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3411 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  719    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  84.15 
 
 
347 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  47.21 
 
 
345 aa  315  9e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  43.44 
 
 
338 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  36.87 
 
 
342 aa  215  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  33.55 
 
 
346 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  29.02 
 
 
341 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  32.81 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  35.04 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  29.28 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  28.48 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  31.31 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  31.04 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  27.73 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  27.73 
 
 
339 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  26.74 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  27.69 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  28.91 
 
 
337 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  27.61 
 
 
348 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  27.55 
 
 
348 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  28.36 
 
 
318 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  29.56 
 
 
334 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.22 
 
 
318 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  27.12 
 
 
476 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  27.16 
 
 
439 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  32.02 
 
 
343 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  28.48 
 
 
298 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  28.31 
 
 
330 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  27.46 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  28.48 
 
 
318 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  28.48 
 
 
318 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  28.31 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  27.74 
 
 
352 aa  96.3  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  26.95 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  26.4 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  28.42 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  33.15 
 
 
546 aa  92.8  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  27.2 
 
 
607 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  25.63 
 
 
312 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  27.3 
 
 
330 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  25.62 
 
 
543 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.31 
 
 
567 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  28.96 
 
 
342 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  27.07 
 
 
568 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  28.09 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  29.51 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  25.45 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.83 
 
 
545 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  32.18 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  27.88 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  29.17 
 
 
533 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  25.97 
 
 
601 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.57 
 
 
547 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  26.73 
 
 
572 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.49 
 
 
567 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  30.65 
 
 
605 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.97 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  27.69 
 
 
542 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  26.73 
 
 
572 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  29.03 
 
 
568 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  25.63 
 
 
565 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  32.74 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  31.79 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  24.51 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  27.7 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  30.84 
 
 
526 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  24.83 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  29.1 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  25.62 
 
 
571 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  31.64 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  24.47 
 
 
600 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  24.47 
 
 
600 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.05 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  25.89 
 
 
278 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.59 
 
 
430 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3164  hypothetical protein  37.96 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2943  hypothetical protein  34.19 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000846327  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  27.31 
 
 
449 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  23.05 
 
 
570 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3288  hypothetical protein  34.78 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350396  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  25.5 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  23.73 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3287  hypothetical protein  31.13 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  25.4 
 
 
449 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  25.53 
 
 
498 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  29.32 
 
 
146 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  31.9 
 
 
319 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  23.18 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  29.82 
 
 
396 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  31.01 
 
 
324 aa  50.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  29.95 
 
 
322 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  31.11 
 
 
324 aa  49.7  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.82 
 
 
706 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.91 
 
 
474 aa  49.3  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4670  hypothetical protein  31.13 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.610067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
665 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11451  putative dienelactone hydrolase  30.09 
 
 
550 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.338208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0390  hypothetical protein  31.62 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.752733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  23.87 
 
 
456 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  32.67 
 
 
652 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>