More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1542 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  100 
 
 		 398 aa  815    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  64.72 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  50.13 
 
 		 385 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2513  6-phosphofructokinase  49.87 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1392  6-phosphofructokinase  47.96 
 
 		 390 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2820  phosphofructokinase  47.7 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0616  6-phosphofructokinase  44.36 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.675369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1732  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  43.64 
 
 		 394 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0376  6-phosphofructokinase  42.28 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2085  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  41.96 
 
 		 394 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1792  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.96 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1871  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  41.96 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.444059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0911  6-phosphofructokinase  41.9 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178607  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3015  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  41.75 
 
 		 366 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  39.02 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  38.59 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  37.57 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  38.61 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  37.27 
 
 		 341 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  37.9 
 
 		 340 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  37 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  35.92 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  36.19 
 
 		 342 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  36.61 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  34.47 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  36.46 
 
 		 341 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  35.66 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  36.97 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  36.34 
 
 		 341 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  36.56 
 
 		 343 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  36.83 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  38.08 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  35.54 
 
 		 345 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  34.5 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  35.04 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  35.97 
 
 		 372 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  35.88 
 
 		 342 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  34.92 
 
 		 346 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 		 341 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  36.34 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  35.12 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  35.2 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  36.83 
 
 		 364 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  35.39 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  36.51 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  34.33 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  35.12 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.07 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  34.5 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  34.5 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  34.5 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  34.93 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  35.9 
 
 		 341 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  34.82 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  35.2 
 
 		 373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  35.16 
 
 		 336 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  37 
 
 		 341 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  33.42 
 
 		 345 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  35.1 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  34.57 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  34.97 
 
 		 363 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  35.68 
 
 		 344 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  33.43 
 
 		 368 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  34.62 
 
 		 342 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  33.88 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  33.42 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  33.68 
 
 		 341 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  33.42 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  35.76 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  32.35 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  34.41 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  35.76 
 
 		 365 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  33.06 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  35.6 
 
 		 363 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  33.8 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  34.59 
 
 		 365 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  31.44 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  34.04 
 
 		 341 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  33.9 
 
 		 359 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 359 aa  168  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  29.84 
 
 		 324 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  29.75 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  29.75 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  31.44 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  33.9 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  32.51 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  31.42 
 
 		 350 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 		 319 aa  163  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  33.87 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  33.42 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  34.15 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0814  6-phosphofructokinase  31.08 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.951954  hitchhiker  0.00745869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  31.35 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1055  6-phosphofructokinase  31.81 
 
 		 320 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0558023  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1164  6-phosphofructokinase  30.34 
 
 		 339 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00769395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  34.17 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  31.48 
 
 		 332 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>