175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0340 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 374 aa  769    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  88.89 
 
 		 370 aa  687    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.47 
 
 		 378 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.79 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  46.88 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  47.95 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  48.36 
 
 		 369 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.61 
 
 		 375 aa  359  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.15 
 
 		 371 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  47.71 
 
 		 372 aa  358  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.63 
 
 		 371 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  46.59 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  46.63 
 
 		 378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.32 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.61 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  45.7 
 
 		 372 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.12 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.36 
 
 		 377 aa  353  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.24 
 
 		 371 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.54 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.92 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.63 
 
 		 371 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.9 
 
 		 376 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.63 
 
 		 371 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.9 
 
 		 371 aa  348  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  48.22 
 
 		 377 aa  348  9e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.22 
 
 		 377 aa  348  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.49 
 
 		 377 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.4 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.54 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.63 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.22 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  45.05 
 
 		 366 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  47.95 
 
 		 377 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.95 
 
 		 377 aa  345  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.12 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.4 
 
 		 377 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.67 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.67 
 
 		 377 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.58 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.14 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  44.84 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.12 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.03 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.03 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.9 
 
 		 377 aa  339  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.85 
 
 		 377 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.93 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.12 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.3 
 
 		 377 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  45.33 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.61 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.22 
 
 		 378 aa  334  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.44 
 
 		 369 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.5 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.11 
 
 		 368 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.72 
 
 		 374 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.44 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  42.47 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.89 
 
 		 367 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.21 
 
 		 370 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.69 
 
 		 414 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  46.92 
 
 		 390 aa  322  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.26 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.9 
 
 		 371 aa  316  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  49.05 
 
 		 372 aa  315  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  42.66 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.16 
 
 		 388 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  47.59 
 
 		 374 aa  309  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  39.73 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.07 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1837  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.22 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151757  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  39.54 
 
 		 378 aa  289  7e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.14 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.86 
 
 		 355 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.89 
 
 		 354 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.94 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.67 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.88 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.19 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.72 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.91 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.19 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.13 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.03 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.5 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.37 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.28 
 
 		 379 aa  250  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.08 
 
 		 377 aa  249  6e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.75 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.62 
 
 		 458 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.87 
 
 		 469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.04 
 
 		 490 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.23 
 
 		 469 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1746  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.87 
 
 		 413 aa  226  6e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  normal  0.01356 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.16 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.28 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.28 
 
 		 466 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.46 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.48 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>