More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2171 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2171  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 375 aa  766    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  74.33 
 
 		 376 aa  595  1e-169  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0007  PUA domain-containing protein  73.26 
 
 		 375 aa  558  1e-158  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0010  PUA domain-containing protein  68.19 
 
 		 377 aa  553  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0394  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.34 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0312752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0494  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.85 
 
 		 389 aa  245  8e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.201395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1346  Fmu (Sun) domain protein  37.27 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.779451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1617  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.57 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  34.21 
 
 		 451 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  34.21 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  34.06 
 
 		 452 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  30.67 
 
 		 446 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  34.21 
 
 		 457 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2219  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.57 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.437229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0909  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.04 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.86309  normal  0.369802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0762  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.04 
 
 		 416 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.644908  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  34.03 
 
 		 485 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  31.46 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.49 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.43 
 
 		 436 aa  87  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  32.45 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  29.39 
 
 		 449 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  30.24 
 
 		 453 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  31.42 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  29.3 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.23 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  31.13 
 
 		 695 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  35.67 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  33.91 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  33.19 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  25.43 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.19 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  30.08 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  33.33 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.34 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  32.11 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  30.52 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  34.1 
 
 		 450 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  30.8 
 
 		 443 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  32.17 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  30.13 
 
 		 443 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.13 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  28.83 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.52 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  26.52 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  27.24 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26.12 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26.12 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  27.5 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  30.35 
 
 		 452 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  25.81 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  30.25 
 
 		 625 aa  79.3  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  33.53 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  30.3 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  30.3 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  34.8 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  31.63 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  34.54 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  31 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.24 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2001  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.63 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  32.34 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  28.21 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  26.88 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  31.58 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.51 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  35.8 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.49 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  36.16 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  31.05 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  31.25 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  31.32 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  29.38 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  32.02 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  31.03 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  28.74 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.5 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  26.75 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  32.19 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  32.57 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.97 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  29.49 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  29.84 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  29.84 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  29.53 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  29.84 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  24.73 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  31.34 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  29.84 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  29.84 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  29.49 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  30.45 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  29.84 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  29.84 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.64 
 
 		 438 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  32.05 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  31.03 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  32.97 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  28.95 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>