150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2351 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  62.27 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  45.6 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  38.28 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  44.2 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  38.6 
 
 		 240 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1498  HPP domain protein  41.74 
 
 		 284 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0190022  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  41.67 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  40.98 
 
 		 449 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  34.21 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 		 392 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  33.91 
 
 		 397 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  33.91 
 
 		 465 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  33.91 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  33.91 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  33.91 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  33.91 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  37.62 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  39.84 
 
 		 404 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  36.46 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  36.2 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  39.41 
 
 		 389 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  35.14 
 
 		 391 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  34.82 
 
 		 238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  36.4 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  40.11 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  33.33 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  37.73 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  37.83 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  36.49 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  36.46 
 
 		 374 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 		 376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  34.98 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  34.68 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  33.2 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  33.2 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  38.12 
 
 		 379 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  38.12 
 
 		 379 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2860  HPP  34.18 
 
 		 231 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  44.64 
 
 		 164 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  35.61 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  34.43 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  34.4 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  35.4 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  35.68 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 		 180 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4192  CBS:HPP  35.35 
 
 		 390 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  32.42 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  36.02 
 
 		 199 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  36.67 
 
 		 179 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  37.5 
 
 		 194 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  31.87 
 
 		 384 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  34.62 
 
 		 389 aa  98.6  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  34.46 
 
 		 199 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  40.91 
 
 		 183 aa  95.9  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  46.4 
 
 		 174 aa  95.9  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  34.42 
 
 		 207 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  38.46 
 
 		 207 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  31.67 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  36.13 
 
 		 231 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  32.93 
 
 		 190 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  32.8 
 
 		 184 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  28.19 
 
 		 391 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  28.18 
 
 		 404 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  31.22 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  40.15 
 
 		 186 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  27.09 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1006  HPP family protein+B94  33.33 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  36.21 
 
 		 175 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  39.1 
 
 		 176 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  34.16 
 
 		 178 aa  85.9  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  32.42 
 
 		 383 aa  85.9  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  42.74 
 
 		 178 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  32.96 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  32.96 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  36.03 
 
 		 185 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0348  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  36.43 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  36.43 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  33.68 
 
 		 181 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  34.13 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  36.43 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  36.43 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  35.66 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0211  CBS domain-containing protein  54.65 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  34.62 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  35.66 
 
 		 184 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  34.88 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  34.88 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>