More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0896 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0896  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  988    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0023842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.71 
 
 
480 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  38.35 
 
 
475 aa  332  1e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1868  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
486 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.04 
 
 
490 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
485 aa  326  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 
486 aa  326  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.13 
 
 
489 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
484 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
492 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
489 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.92 
 
 
489 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3829  succinate semialdehyde dehydrogenase  37 
 
 
482 aa  319  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2023  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
490 aa  319  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.491893  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
500 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.02 
 
 
509 aa  318  9e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
480 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  35.56 
 
 
485 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.38 
 
 
480 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
484 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2120  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
489 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
489 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.65 
 
 
493 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.5 
 
 
482 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
489 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
489 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.08 
 
 
489 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
500 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  35.5 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.15 
 
 
484 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.5 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1481  succinate-semialdehyde dehydrogenase  35.29 
 
 
489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.670932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.46 
 
 
483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.81 
 
 
483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.1 
 
 
483 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1888  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
485 aa  312  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000160423  normal  0.0242248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.5 
 
 
500 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1785  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.02 
 
 
486 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
492 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2232  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.32 
 
 
490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.179886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.33 
 
 
483 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.51 
 
 
489 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.9 
 
 
488 aa  310  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.48 
 
 
503 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
474 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4032  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.99 
 
 
481 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.64 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.03 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.03 
 
 
482 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.55 
 
 
497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
479 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.82 
 
 
482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.06 
 
 
503 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2207  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  36.13 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.335018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.82 
 
 
482 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4681  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
492 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8306  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.79 
 
 
493 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.985186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.9 
 
 
483 aa  306  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
479 aa  306  8.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.61 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.44 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.47 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3173  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.41 
 
 
485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.11 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.36 
 
 
488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.32 
 
 
480 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.11 
 
 
480 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2142  Aldehyde Dehydrogenase  35.17 
 
 
486 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
502 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.75 
 
 
482 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2493  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.53 
 
 
490 aa  303  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
496 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
474 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4665  succinate-semialdehyde dehydrogenase  37.77 
 
 
494 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.99 
 
 
479 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.1 
 
 
482 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.82 
 
 
482 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.7 
 
 
487 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  36.19 
 
 
494 aa  301  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
484 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2324  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
492 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.832005  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  35.92 
 
 
491 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.67 
 
 
487 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.4 
 
 
482 aa  301  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.53 
 
 
483 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  33.82 
 
 
482 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3863  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
485 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.59 
 
 
488 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.12 
 
 
485 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  35.53 
 
 
479 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3095  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.76 
 
 
491 aa  299  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.628741  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.74 
 
 
486 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>