210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0426 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 155 aa  320  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  52.11 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 		 145 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  52.03 
 
 		 175 aa  157  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  54.35 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  54.35 
 
 		 203 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.24 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  55.64 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  55.64 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  52.24 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  53.28 
 
 		 181 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  53.28 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  52.86 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  53.28 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  53.28 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  54.14 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  53.28 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  54.48 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  53.1 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  51.09 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  45.27 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  53.08 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  51.05 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  47.33 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  54.55 
 
 		 150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  46.85 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  53.85 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  46.85 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 		 142 aa  140  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  49.28 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  48.94 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  48.51 
 
 		 145 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  49.28 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  48.12 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  48.63 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  48.55 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 		 137 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  48.87 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  55.75 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  45.32 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 		 137 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  45.71 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  42.45 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  41.43 
 
 		 151 aa  118  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  36.08 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 		 146 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  36.88 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  28.67 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  32.45 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 292 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.95 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 		 287 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  28.87 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 286 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 		 287 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  28.15 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  32.54 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  31.75 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  26.35 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  28.68 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.66 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>