More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2116 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  65.89 
 
 
480 aa  654  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  100 
 
 
475 aa  984  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  4.36427e-09  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  67.58 
 
 
483 aa  672  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  68.31 
 
 
471 aa  675  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.07035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  66.74 
 
 
471 aa  645  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  73.82 
 
 
470 aa  733  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  65.24 
 
 
479 aa  626  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  56.56 
 
 
472 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  54.18 
 
 
476 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.49 
 
 
472 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  54.96 
 
 
477 aa  536  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  53.96 
 
 
473 aa  533  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  53.65 
 
 
474 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.31 
 
 
478 aa  519  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  33.78 
 
 
444 aa  245  2e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 
439 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  33.25 
 
 
433 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 
434 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 
444 aa  219  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
428 aa  216  6e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 
459 aa  214  2e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  31.68 
 
 
428 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 
426 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
429 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  33.61 
 
 
434 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.92659e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  31.62 
 
 
428 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 
448 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 
446 aa  206  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 
433 aa  205  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 
449 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  31.09 
 
 
430 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  29.53 
 
 
441 aa  197  4e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
462 aa  183  5e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 
445 aa  182  8e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 
467 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  32.25 
 
 
502 aa  181  3e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 
469 aa  179  9e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 
477 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.04661e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 
486 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.56 
 
 
461 aa  177  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
477 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 
467 aa  176  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 
471 aa  174  4e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 
471 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 
468 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.57 
 
 
465 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.38 
 
 
462 aa  170  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 
469 aa  170  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 
471 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.7 
 
 
471 aa  166  1e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 
509 aa  164  5e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  28.22 
 
 
490 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 
468 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 
520 aa  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 
465 aa  154  3e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 
500 aa  152  9e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.4 
 
 
461 aa  152  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 
498 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 
490 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 
527 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 
468 aa  149  1e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.44 
 
 
466 aa  149  1e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 
448 aa  148  2e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
468 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 
493 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 
468 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.48 
 
 
503 aa  142  1e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  30.06 
 
 
529 aa  142  1e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.12719e-07  decreased coverage  3.67319e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 
504 aa  142  2e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  27.29 
 
 
503 aa  140  4e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 
444 aa  140  5e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 
422 aa  140  5e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
501 aa  139  9e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
503 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  29.2 
 
 
532 aa  137  3e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  28.06 
 
 
504 aa  136  7e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
522 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 
469 aa  135  2e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  25.06 
 
 
445 aa  134  4e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 
533 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
498 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 
512 aa  132  2e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 
504 aa  131  2e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 
462 aa  130  5e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 
450 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  25.9 
 
 
591 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 
502 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 
444 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 
600 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 
523 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  25.9 
 
 
533 aa  122  2e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 
527 aa  115  1e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  25.21 
 
 
524 aa  114  4e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.07 
 
 
522 aa  114  4e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  24.07 
 
 
495 aa  114  4e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 
529 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  3.47162e-06 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.56 
 
 
524 aa  112  1e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  25.29 
 
 
529 aa  112  1e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.47 
 
 
441 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 
527 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>