48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1552 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  4.99206e-11  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  42.51 
 
 
229 aa  135  3e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  3.21544e-08  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  41.43 
 
 
234 aa  134  1e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.21027e-11  unclonable  2.18864e-06 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  37.9 
 
 
243 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  2.19065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  38.81 
 
 
227 aa  118  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  37.74 
 
 
222 aa  117  1e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.64582e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  35.85 
 
 
237 aa  114  7e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  7.65073e-06  hitchhiker  3.18846e-05 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  39.04 
 
 
194 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  35.55 
 
 
231 aa  104  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  4.90319e-08  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  37.93 
 
 
227 aa  104  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  32.43 
 
 
249 aa  98.2  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.60026e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  32.82 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  32.28 
 
 
190 aa  84.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  4.33571e-07  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  33.33 
 
 
195 aa  82.4  4e-15  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  9.82114e-11  unclonable  6.60987e-07 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  31.09 
 
 
195 aa  79.7  3e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  29.63 
 
 
215 aa  77.4  1e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  2.37774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  31.22 
 
 
202 aa  74.3  1e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.93309e-08  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  32.72 
 
 
203 aa  74.3  1e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  1.6508e-06  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  28.11 
 
 
202 aa  72.4  4e-12  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  31.12 
 
 
219 aa  70.5  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  34.13 
 
 
222 aa  70.5  2e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  30.53 
 
 
206 aa  68.9  4e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  30.85 
 
 
224 aa  67.4  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  27.45 
 
 
201 aa  66.2  3e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  31.82 
 
 
213 aa  65.9  3e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.66058e-13 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.63 
 
 
190 aa  64.3  1e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  1.02603e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  30.85 
 
 
186 aa  64.3  1e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.41 
 
 
196 aa  63.5  2e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  5.83804e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  27.55 
 
 
209 aa  62.4  4e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.77895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  28.36 
 
 
224 aa  60.8  1e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  26.29 
 
 
183 aa  55.5  6e-07  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  28.96 
 
 
373 aa  48.1  9e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  30.59 
 
 
361 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  30.3 
 
 
181 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  30.3 
 
 
181 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4755  heat resistant agglutinin 1  27.35 
 
 
263 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.514433  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4959  porin, opacity type  30.73 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3201  porin, opacity type  30.73 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  28.27 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  31.03 
 
 
340 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  26.14 
 
 
380 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  25.87 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  25.87 
 
 
230 aa  42.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  28.36 
 
 
357 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1046  surface antigen msp4 family protein  26.94 
 
 
223 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3164  hypothetical protein  28.57 
 
 
227 aa  41.2  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  25 
 
 
359 aa  41.2  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  29.82 
 
 
373 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>