More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5084 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5084  malonate decarboxylase, beta subunit  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0445  malonate decarboxylase subunit beta  96.81 
 
 		 283 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5299  malonate decarboxylase subunit beta  81.21 
 
 		 283 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2880  malonate decarboxylase subunit beta  74.3 
 
 		 282 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10310  malonate decarboxylase subunit beta  72.79 
 
 		 283 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00325574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0949  malonate decarboxylase subunit beta  70.36 
 
 		 292 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2441  malonate decarboxylase subunit beta  73.67 
 
 		 282 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02580  malonate decarboxylase subunit beta  73.57 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0046071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0295  malonate decarboxylase subunit beta  72.86 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.354415  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4942  malonate decarboxylase subunit beta  69.37 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0873068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3866  malonate decarboxylase subunit beta  69.37 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4928  malonate decarboxylase subunit beta  67.39 
 
 		 286 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3776  malonate decarboxylase subunit beta  70.15 
 
 		 277 aa  355  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1244  malonate decarboxylase subunit beta  68.98 
 
 		 277 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2609  malonate decarboxylase subunit beta  68.75 
 
 		 277 aa  340  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.17179  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5084  malonate decarboxylase subunit beta  60.22 
 
 		 296 aa  331  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297024  normal  0.137892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1847  malonate decarboxylase subunit beta  61.76 
 
 		 300 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5038  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4818  malonate decarboxylase subunit beta  60.37 
 
 		 294 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.049139  normal  0.0262322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3657  Acetyl-CoA carboxylase beta subunit-like protein  58.8 
 
 		 380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4590  malonate decarboxylase subunit beta  54.95 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0792  beta subunit of malonate decarboxylase  46.59 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0446247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1845  malonate decarboxylase subunit beta  44.71 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5372  malonate decarboxylase subunit beta  43.53 
 
 		 292 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4018  malonate decarboxylase subunit beta  45.96 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2894  acetyl-CoA carboxylase beta subunit  43.65 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25289  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1079  malonate decarboxylase subunit beta  47.42 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1144  malonate decarboxylase subunit beta  43.42 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.431032  normal  0.55922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1059  malonate decarboxylase subunit beta  38.7 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0077  malonate decarboxylase subunit beta  46.12 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.405933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2893  malonate decarboxylase subunit beta  44.75 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1766  malonate decarboxylase subunit beta  41.41 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1324  malonate decarboxylase subunit beta  37.15 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1161  malonate decarboxylase subunit beta  48.21 
 
 		 307 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1149  malonate decarboxylase subunit beta  48.85 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0026  malonate decarboxylase subunit beta  47.77 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.840906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3296  malonate decarboxylase subunit beta  37.33 
 
 		 318 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0790  malonate decarboxylase subunit beta  48.66 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.052226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1271  malonate decarboxylase subunit beta  48.66 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00826271  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2048  malonate decarboxylase subunit beta  51.22 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4414  malonate decarboxylase subunit beta  48.21 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.671916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4288  malonate decarboxylase subunit beta  46.64 
 
 		 302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0169  malonate decarboxylase subunit beta  45.53 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1243  malonate decarboxylase subunit beta  48.21 
 
 		 311 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  0.0801604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0048  malonate decarboxylase subunit beta  46.43 
 
 		 310 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179733  normal  0.0754943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0027  malonate decarboxylase subunit beta  47.32 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6855  malonate decarboxylase subunit beta  46.43 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3153  malonate decarboxylase subunit beta  44.68 
 
 		 306 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3190  malonate decarboxylase subunit beta  44.83 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2494  malonate decarboxylase subunit beta  39.15 
 
 		 398 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2801  malonate decarboxylase subunit beta  46.4 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1484  malonate decarboxylase subunit beta  44.59 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0541  malonate decarboxylase subunit beta  44.59 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0612  malonate decarboxylase subunit beta  44.59 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3035  malonate decarboxylase subunit beta  44.59 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1584  malonate decarboxylase subunit beta  44.59 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1454  malonate decarboxylase subunit beta  44.59 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1258  malonate decarboxylase subunit beta  44.59 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2471  malonate decarboxylase gamma subunit  32.35 
 
 		 499 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.719653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  37.43 
 
 		 541 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0034  carboxyl transferase  33.68 
 
 		 516 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3083  carboxyl transferase  33.68 
 
 		 516 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2596  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.52 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2508  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.52 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2554  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.52 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2717  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.52 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2608  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.52 
 
 		 304 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12852  normal  0.0772282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  32.02 
 
 		 522 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02241  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334325  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2694  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1336  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2610  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02201  hypothetical protein  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3456  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2472  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  35.03 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  34.38 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1467  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.65 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2865  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  34.01 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2798  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.65 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.408856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1263  acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  35.26 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  34.02 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1370  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.14 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325011  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1531  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.5 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1422  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.5 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0359  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.5 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3332  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  33.33 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2574  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  32.49 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  34.22 
 
 		 534 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  33.86 
 
 		 530 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  32.47 
 
 		 531 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1281  carboxyl transferase  33.04 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  34.54 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  34.21 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1593  carboxyl transferase  32.83 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0139637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2370  acetyl-CoA carboxylase, carboxyl transferase, beta subunit  31.5 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00172685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  32 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  31.84 
 
 		 516 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  32.63 
 
 		 530 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2437  propionyl-CoA carboxylase  31.82 
 
 		 477 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000506601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>