155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0057 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  98.64 
 
 
295 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  60.14 
 
 
404 aa  357  1e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  60.35 
 
 
395 aa  357  2e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  61.31 
 
 
444 aa  356  2e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  59.2 
 
 
486 aa  356  3e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  61.99 
 
 
404 aa  355  3e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  61.99 
 
 
404 aa  355  3e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  61.99 
 
 
404 aa  355  3e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  60.45 
 
 
295 aa  355  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  60.45 
 
 
295 aa  355  4e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  61.99 
 
 
395 aa  355  4e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  60.34 
 
 
293 aa  355  6e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  60.07 
 
 
295 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  1.47175e-08 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  64.71 
 
 
299 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  58.45 
 
 
294 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  60.21 
 
 
293 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  58.16 
 
 
291 aa  342  3e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  59.78 
 
 
291 aa  338  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  63.26 
 
 
291 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  59.06 
 
 
287 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  57.41 
 
 
293 aa  331  8e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  57.09 
 
 
293 aa  330  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  57.78 
 
 
317 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  54.92 
 
 
291 aa  327  1e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  57.52 
 
 
317 aa  327  1e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  56.02 
 
 
303 aa  315  6e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  57.74 
 
 
292 aa  309  3e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  50.53 
 
 
299 aa  305  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  50.35 
 
 
299 aa  303  3e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  50.18 
 
 
299 aa  303  3e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  50.18 
 
 
299 aa  303  3e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  59.09 
 
 
296 aa  301  6e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  50.37 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  50.37 
 
 
307 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  50.37 
 
 
307 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  50.37 
 
 
307 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  48.89 
 
 
307 aa  287  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  49.66 
 
 
283 aa  282  5e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  45.15 
 
 
292 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  43.48 
 
 
298 aa  244  1e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  46.35 
 
 
293 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.41 
 
 
289 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  39.44 
 
 
288 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  39.36 
 
 
288 aa  212  5e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.04 
 
 
299 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  42.81 
 
 
293 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  36.64 
 
 
304 aa  205  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  40.61 
 
 
266 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  35.21 
 
 
273 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  33.7 
 
 
273 aa  164  1e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.46635e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  34.19 
 
 
293 aa  164  2e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  37.78 
 
 
292 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  32.66 
 
 
302 aa  118  1e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  3.15394e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  25.17 
 
 
301 aa  68.9  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  29.52 
 
 
342 aa  64.7  2e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
332 aa  62.8  7e-09  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 
325 aa  60.8  3e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.2 
 
 
319 aa  60.1  4e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
321 aa  60.5  4e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 
526 aa  60.1  5e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 
278 aa  59.3  8e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 
312 aa  58.5  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  27.12 
 
 
319 aa  57  3e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  31.09 
 
 
597 aa  57.4  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  26.09 
 
 
316 aa  56.2  6e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  24.61 
 
 
274 aa  55.8  7e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  22.07 
 
 
299 aa  55.8  8e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
317 aa  55.8  9e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
264 aa  55.5  1e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.57 
 
 
318 aa  55.5  1e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 
319 aa  54.7  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  25 
 
 
316 aa  54.7  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  25.83 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  27.56 
 
 
319 aa  54.3  3e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  29.46 
 
 
329 aa  54.3  3e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  26.99 
 
 
319 aa  54.3  3e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 
318 aa  53.9  3e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 
315 aa  53.5  4e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  25.22 
 
 
317 aa  52.8  7e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  25 
 
 
318 aa  52.8  7e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
337 aa  52.4  8e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
319 aa  52.8  8e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
319 aa  52.8  8e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 
312 aa  52.4  9e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  25.93 
 
 
319 aa  52.4  1e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  1.47099e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
319 aa  52  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  2.19811e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
310 aa  52  1e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.25 
 
 
291 aa  52  1e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  1.02654e-05 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
319 aa  51.2  2e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.61 
 
 
319 aa  51.6  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
336 aa  51.2  2e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  26.61 
 
 
319 aa  51.2  2e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  26.29 
 
 
321 aa  50.4  3e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>