More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1792 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 809 aa  1654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  65.13 
 
 		 796 aa  1008    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  68.71 
 
 		 808 aa  1106    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  40.29 
 
 		 731 aa  321  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 		 632 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  39.28 
 
 		 958 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 		 602 aa  305  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 		 733 aa  301  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 1509 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 		 617 aa  294  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  39.95 
 
 		 625 aa  293  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  39.95 
 
 		 625 aa  293  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  39.37 
 
 		 1275 aa  283  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 723 aa  283  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 709 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 		 709 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 		 586 aa  280  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 625 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.56 
 
 		 1561 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 765 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  39.08 
 
 		 670 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.94 
 
 		 610 aa  269  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  39.71 
 
 		 728 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 		 531 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 1334 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  38.07 
 
 		 635 aa  258  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 		 775 aa  256  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 		 1486 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 658 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  42 
 
 		 555 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 		 717 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 717 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 		 710 aa  254  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  37.35 
 
 		 576 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 		 684 aa  251  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  42.03 
 
 		 551 aa  250  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 746 aa  248  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 		 721 aa  247  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 		 653 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  39.45 
 
 		 551 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  27.37 
 
 		 810 aa  244  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 652 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 784 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  43.92 
 
 		 783 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  35.99 
 
 		 662 aa  236  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 832 aa  237  8e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 526 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 		 729 aa  232  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 		 880 aa  232  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 		 1067 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 1152 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 		 684 aa  231  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 1152 aa  231  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 		 790 aa  229  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 1991 aa  229  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  43.15 
 
 		 1359 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  43.54 
 
 		 1759 aa  229  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  33.92 
 
 		 988 aa  228  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.45 
 
 		 1644 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  34.45 
 
 		 1644 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  32.47 
 
 		 632 aa  224  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  41.81 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  35.32 
 
 		 1182 aa  219  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 		 794 aa  216  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 996 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 		 556 aa  198  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 		 732 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 		 958 aa  197  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 725 aa  197  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 		 725 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 983 aa  191  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 		 1297 aa  185  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 		 1084 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 742 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 1213 aa  178  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 857 aa  177  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  31.26 
 
 		 742 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 742 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 		 748 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 1188 aa  170  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 		 1198 aa  164  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 1193 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  34.32 
 
 		 972 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  26.26 
 
 		 783 aa  158  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.99 
 
 		 1173 aa  157  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.66 
 
 		 1191 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1162 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 1177 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 974 aa  146  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 1190 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 1187 aa  144  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  33.08 
 
 		 1171 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  38.02 
 
 		 1003 aa  138  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1694 aa  138  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 1739 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 2046 aa  135  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 968 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 965 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 		 968 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>