More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1549 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1549  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16461  F0F1 ATP synthase subunit A  99.59 
 
 
241 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16581  F0F1 ATP synthase subunit A  99.17 
 
 
241 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15751  F0F1 ATP synthase subunit A  90.52 
 
 
241 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  87.5 
 
 
241 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18541  F0F1 ATP synthase subunit A  89.66 
 
 
241 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0228025  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0986  F0F1 ATP synthase subunit A  89.66 
 
 
241 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  80.17 
 
 
241 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16351  F0F1 ATP synthase subunit A  99.47 
 
 
188 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  77.59 
 
 
241 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  76.52 
 
 
261 aa  333  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  69.51 
 
 
251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  69.51 
 
 
251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2616  F0F1 ATP synthase subunit A  71.37 
 
 
251 aa  300  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68842  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2204  F0F1 ATP synthase subunit A  66.09 
 
 
249 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3581  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  64.66 
 
 
257 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  66.67 
 
 
252 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  68.72 
 
 
253 aa  294  9e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4797  ATP synthase F0, A subunit  33.33 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  37.39 
 
 
234 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  35.68 
 
 
227 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  36.67 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  37.14 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  37.62 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  37.91 
 
 
239 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  37.62 
 
 
234 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  32.8 
 
 
246 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  32.58 
 
 
218 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  37.5 
 
 
239 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
251 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  33.94 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  35.89 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.69 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  36.16 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2332  F0F1 ATP synthase subunit A  33.63 
 
 
236 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  35.64 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  35.82 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  34.51 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  34.22 
 
 
231 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  35.9 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  36.59 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  36.32 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2602  F0F1 ATP synthase subunit A  34.4 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00882064  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  36.32 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.31 
 
 
231 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  37.93 
 
 
194 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  34.74 
 
 
232 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  33.77 
 
 
223 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  32.86 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  32.86 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  34.29 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  34.51 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  33.5 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  33.5 
 
 
226 aa  112  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1125  F0F1 ATP synthase subunit A  37.62 
 
 
231 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16774  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1958  F0F1 ATP synthase subunit A  32.3 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  31.65 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3053  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  35.75 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0467  F0F1 ATP synthase subunit A  34.5 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.104154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19710  F0F1 ATP synthase subunit A  39.89 
 
 
228 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0388023  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  32.74 
 
 
225 aa  109  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  34.78 
 
 
226 aa  108  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 
235 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0197  ATP synthase F0, A subunit  29.6 
 
 
301 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000520668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  33.04 
 
 
230 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  35.27 
 
 
233 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  33.19 
 
 
233 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  29.87 
 
 
217 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  30.81 
 
 
234 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  32.23 
 
 
229 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  31.14 
 
 
227 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 
239 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  35.87 
 
 
228 aa  102  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  31.9 
 
 
228 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0516  F0F1 ATP synthase subunit A  31.68 
 
 
235 aa  102  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000641483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0892  F0F1 ATP synthase subunit A  31.14 
 
 
223 aa  101  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.546785  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  40.67 
 
 
227 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  40.67 
 
 
227 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0461  ATP synthase F0, A subunit  32.9 
 
 
235 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000814456  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  31.88 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  30.96 
 
 
284 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0647  F0F1 ATP synthase subunit A  31.44 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0568959  normal  0.182901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5433  F0F1 ATP synthase subunit A  30.49 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  29.79 
 
 
262 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0659  F0F1-type ATP synthase, subunit a  31.67 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.320134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  31.75 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  33.01 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  32.69 
 
 
228 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5161  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4994  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000342727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5402  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.39849e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5553  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000158416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3831  F0F1 ATP synthase subunit A  30.49 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000137067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3421  F0F1 ATP synthase subunit A  31.96 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5436  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5011  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110706  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5489  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000703666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5518  F0F1 ATP synthase subunit A  30.04 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000410336  hitchhiker  3.2870800000000003e-19 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  30.87 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>