More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35101 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  100 
 
 
570 aa  1185    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  42.08 
 
 
448 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  40.11 
 
 
473 aa  243  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  38.81 
 
 
446 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  36.93 
 
 
449 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  40.11 
 
 
476 aa  223  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  34.98 
 
 
450 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  40.44 
 
 
443 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  36.76 
 
 
455 aa  217  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  36.32 
 
 
435 aa  210  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  36.43 
 
 
480 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  37.95 
 
 
468 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  35.5 
 
 
449 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  38.92 
 
 
457 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  36.11 
 
 
503 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  37.69 
 
 
442 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  35.14 
 
 
447 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  35.14 
 
 
447 aa  191  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  37.96 
 
 
453 aa  190  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  30.38 
 
 
453 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  38.52 
 
 
569 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  30.16 
 
 
453 aa  188  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  30.38 
 
 
453 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  30.38 
 
 
453 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  30.16 
 
 
453 aa  187  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  30.65 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  30.65 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  30.65 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  30.65 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  30.16 
 
 
453 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  34.94 
 
 
473 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  29.93 
 
 
453 aa  182  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  32.07 
 
 
506 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  32.24 
 
 
481 aa  169  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  33.08 
 
 
461 aa  159  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.66 
 
 
454 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  29.14 
 
 
452 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  33.08 
 
 
449 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  33.98 
 
 
448 aa  144  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.87 
 
 
494 aa  140  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  28.25 
 
 
458 aa  139  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.76 
 
 
457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  30.43 
 
 
579 aa  130  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  27.54 
 
 
449 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  26.23 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  29.07 
 
 
474 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  26.7 
 
 
462 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  28.3 
 
 
394 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  28.85 
 
 
454 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  26.63 
 
 
432 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  26.32 
 
 
435 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  26.16 
 
 
425 aa  98.2  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  27.18 
 
 
484 aa  97.4  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  27.16 
 
 
469 aa  97.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  24.34 
 
 
478 aa  95.9  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2544  amidohydrolase  27.46 
 
 
459 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  25.93 
 
 
468 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  27.02 
 
 
488 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  27.74 
 
 
445 aa  93.6  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.3 
 
 
433 aa  93.2  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  26.65 
 
 
484 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.23 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.79 
 
 
441 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  26.05 
 
 
425 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  24.34 
 
 
475 aa  91.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.42 
 
 
434 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  26.43 
 
 
447 aa  91.3  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  26.46 
 
 
443 aa  91.3  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  26.46 
 
 
443 aa  91.3  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  26.42 
 
 
464 aa  91.3  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  25.59 
 
 
454 aa  91.3  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  26.48 
 
 
459 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  30.61 
 
 
458 aa  90.1  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.5 
 
 
437 aa  90.1  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  25.85 
 
 
456 aa  90.1  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.24 
 
 
434 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  27.27 
 
 
445 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  25.59 
 
 
470 aa  88.6  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4364  Allantoinase  27.32 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00228036 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  26.42 
 
 
464 aa  88.2  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  27.22 
 
 
451 aa  87.4  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  26.26 
 
 
425 aa  87  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  26.26 
 
 
425 aa  87  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  25.64 
 
 
444 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  24.27 
 
 
455 aa  87.4  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3013  amidohydrolase  26.26 
 
 
461 aa  87  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  25.81 
 
 
440 aa  87  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.17 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  24.86 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  24.79 
 
 
501 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  24.23 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  24.23 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  24.23 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  23.64 
 
 
432 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  22.61 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  22.95 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  24.79 
 
 
483 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  22.27 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2641  amidohydrolase  27.88 
 
 
452 aa  84  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  24.77 
 
 
427 aa  84  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>