More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16615 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  100 
 
 
325 aa  664    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  48.18 
 
 
332 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10340  hexaprenyl pyrophosphate synthetase Coq1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06120)  42.41 
 
 
456 aa  281  8.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  45.87 
 
 
309 aa  278  7e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  47.37 
 
 
323 aa  278  8e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  44.72 
 
 
323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  42.86 
 
 
323 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
323 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  45.14 
 
 
323 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
323 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  44.1 
 
 
323 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  45.34 
 
 
323 aa  260  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  45.45 
 
 
323 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  47.21 
 
 
323 aa  257  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  45.39 
 
 
323 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  45.39 
 
 
323 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  44.12 
 
 
323 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  44.97 
 
 
323 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  44.12 
 
 
323 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  44.12 
 
 
323 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  44.12 
 
 
323 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01740  trans-hexaprenyltranstransferase, putative  50.72 
 
 
483 aa  245  8e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  45.72 
 
 
323 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  41.96 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86778  hexaprenyl pyrophosphate synthetase, mitochondrial precursor (HPS)  43.52 
 
 
465 aa  230  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.337551  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  35.18 
 
 
322 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.41 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  35.76 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  35.41 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  35.41 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  32.9 
 
 
313 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.55 
 
 
320 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  33.9 
 
 
323 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  29.52 
 
 
331 aa  159  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  34.43 
 
 
322 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  32.47 
 
 
318 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  35.1 
 
 
322 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  32.9 
 
 
330 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  32.76 
 
 
323 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  31.63 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  39.36 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  34.44 
 
 
322 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  31.4 
 
 
323 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  30 
 
 
323 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  33.86 
 
 
327 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.97 
 
 
320 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.61 
 
 
320 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1465  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.22 
 
 
319 aa  153  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00436047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  31.51 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  30.46 
 
 
326 aa  152  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  31.63 
 
 
323 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0722  polyprenyl synthetase  32.72 
 
 
339 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.197048  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  30.3 
 
 
322 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  39.59 
 
 
334 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  32.18 
 
 
323 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  33.11 
 
 
322 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  30.25 
 
 
322 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  33.11 
 
 
322 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.13 
 
 
322 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  29.66 
 
 
323 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  30.51 
 
 
343 aa  149  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  29.09 
 
 
370 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  29.09 
 
 
370 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  31.48 
 
 
323 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.17 
 
 
322 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  29.09 
 
 
370 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  29.09 
 
 
370 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  29.09 
 
 
370 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  32.04 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  32.04 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.27 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.27 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.27 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.27 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.27 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.27 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.93 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  32.04 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  28.92 
 
 
323 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  28.92 
 
 
323 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.17 
 
 
323 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  28.92 
 
 
323 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  28.92 
 
 
323 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.59 
 
 
335 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  28.92 
 
 
323 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  28.92 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  28.96 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.11 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  29.09 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.79 
 
 
320 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  29.18 
 
 
332 aa  145  8.000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  30.77 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  36.14 
 
 
319 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  31.53 
 
 
322 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  32.35 
 
 
322 aa  145  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  32.08 
 
 
331 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  28.06 
 
 
327 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>