More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0628 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  72.13 
 
 		 244 aa  363  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  69.83 
 
 		 245 aa  361  7.0000000000000005e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  71.49 
 
 		 254 aa  358  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  69.83 
 
 		 243 aa  353  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  71.49 
 
 		 243 aa  353  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  66.53 
 
 		 246 aa  344  6e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  68.03 
 
 		 247 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  66.8 
 
 		 246 aa  342  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  66.94 
 
 		 243 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  62.25 
 
 		 249 aa  318  5e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  61.25 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  61.41 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  61.51 
 
 		 244 aa  306  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  61.92 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  61.92 
 
 		 244 aa  301  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  59.09 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  60.08 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  59.5 
 
 		 242 aa  291  7e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  58.4 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  57.56 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  57.56 
 
 		 265 aa  288  8e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  57.38 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2507  ABC transporter related  59.91 
 
 		 243 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  56.07 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  55.27 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  58.75 
 
 		 242 aa  282  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  56.3 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  56.3 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  55.88 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  58.4 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  59.17 
 
 		 241 aa  278  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  55.88 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.3 
 
 		 241 aa  278  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  57.98 
 
 		 277 aa  278  7e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  56.3 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  55.88 
 
 		 241 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  57.61 
 
 		 311 aa  277  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  55.88 
 
 		 241 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  54.55 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  55.88 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0679  ABC transporter related  54.92 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  57.08 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  55.65 
 
 		 241 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  55.37 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  57.08 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  54.88 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2121  ABC transporter related  55.56 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2168  ABC transporter related  55.56 
 
 		 243 aa  275  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  54.81 
 
 		 241 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  55.7 
 
 		 252 aa  275  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  55.23 
 
 		 241 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  56.9 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  56.9 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  55.04 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  57.56 
 
 		 242 aa  274  8e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  54.77 
 
 		 251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  55.97 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  57.98 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2272  ABC transporter related  57.44 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  56.12 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  56.9 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1506  ABC transporter related  53.36 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0341851  hitchhiker  0.00249161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  55.27 
 
 		 247 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  56.56 
 
 		 289 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  53.16 
 
 		 241 aa  271  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.04 
 
 		 241 aa  271  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  56.45 
 
 		 266 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.04 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  56.97 
 
 		 289 aa  270  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  57.56 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  56.05 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  56.12 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  53.78 
 
 		 259 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  56.15 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  54.62 
 
 		 241 aa  268  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.19 
 
 		 268 aa  268  7e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  55.79 
 
 		 310 aa  268  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  55.88 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4168  ABC transporter, ATPase subunit  55.88 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  53.78 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  56.2 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4321  ABC transporter related  54.69 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.955578  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 		 262 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  56.47 
 
 		 288 aa  266  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  53.36 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  55.04 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2714  ABC transporter related  56.49 
 
 		 241 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  54.22 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  55.37 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  55.23 
 
 		 245 aa  265  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  54.43 
 
 		 268 aa  265  8e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  53.25 
 
 		 246 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>