More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1260 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  99.53 
 
 
212 aa  420  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  76.33 
 
 
209 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  63.37 
 
 
209 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  61.39 
 
 
209 aa  254  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  54.88 
 
 
227 aa  234  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  54.37 
 
 
208 aa  223  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  38.78 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  45.45 
 
 
215 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 
214 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 
214 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  38.67 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  42.77 
 
 
214 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
213 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  36.68 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  40.38 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  42.57 
 
 
245 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 
217 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  36.42 
 
 
215 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  35.75 
 
 
218 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
457 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  35.75 
 
 
355 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.07 
 
 
211 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.43 
 
 
217 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  30.96 
 
 
206 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  32.07 
 
 
200 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  36.65 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  30.73 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  34.71 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  33.73 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  34.88 
 
 
204 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  37.04 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.78 
 
 
203 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  30.73 
 
 
203 aa  89  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  35.12 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  31.01 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  34.51 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  31.01 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  31.01 
 
 
204 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  31.01 
 
 
204 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  31.01 
 
 
204 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  31.01 
 
 
204 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  31.01 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  30.38 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  31.01 
 
 
204 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  31.67 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  30.25 
 
 
202 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  34.71 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  31.01 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  30.43 
 
 
198 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  28.43 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  31.03 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  33.11 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  29.1 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  29.76 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  31.76 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  38.93 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  31.68 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  36.69 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  31.98 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  33.11 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  37.06 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  33.33 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  29.02 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  34.25 
 
 
172 aa  82  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  29.41 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  31.1 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  32.29 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  29.33 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2311  hypothetical protein  31.33 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.78 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.17 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  30.11 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  29.29 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  31.82 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.96 
 
 
521 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  30.41 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 
214 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  37.32 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  27.57 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  31.41 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0816  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0140193 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1057  alkaline phosphatase  33.74 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000034861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  30.81 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  30.77 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  32.16 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  31.03 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  31.09 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3042  SNARE associated Golgi protein  28.9 
 
 
208 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.537249  normal  0.212415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  31.13 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.18 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3718  DedA family protein  35.92 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.913537  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  29.33 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.91 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>