289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0376 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 167 aa  347  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0427  GCN5-related N-acetyltransferase  91.02 
 
 		 167 aa  317  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  74.85 
 
 		 167 aa  261  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3682  GCN5-related N-acetyltransferase  74.85 
 
 		 167 aa  260  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.98699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3546  acetyltransferase  74.85 
 
 		 167 aa  260  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4044  acetyltransferase  74.85 
 
 		 167 aa  259  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0559  GCN5-related N-acetyltransferase  72.46 
 
 		 177 aa  252  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.518435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3564  GCN5-related N-acetyltransferase  73.05 
 
 		 167 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  66.24 
 
 		 167 aa  224  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  66.24 
 
 		 167 aa  223  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  66.47 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  67.07 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  67.07 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  67.07 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  66.47 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  64.15 
 
 		 312 aa  207  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  62.34 
 
 		 349 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 349 aa  200  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 313 aa  200  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 347 aa  200  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  67.52 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  67.52 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  67.52 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  65.43 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  66.88 
 
 		 167 aa  197  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  66.88 
 
 		 167 aa  197  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  66.88 
 
 		 167 aa  197  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  60.39 
 
 		 320 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 322 aa  194  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  63.83 
 
 		 340 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  56.69 
 
 		 283 aa  192  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 309 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  57.32 
 
 		 301 aa  191  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  62.34 
 
 		 347 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  53.14 
 
 		 352 aa  187  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  54.17 
 
 		 173 aa  177  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 334 aa  177  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 326 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  54.55 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  63.12 
 
 		 340 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  63.12 
 
 		 326 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1391  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 307 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  43.95 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  45.34 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  40.76 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  42.5 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  39.62 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  37.97 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  37.34 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1339  acetyltransferase  36.88 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  34.69 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  31.39 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3535  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0151129 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 315 aa  65.1  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4677  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  31.93 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  34.35 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0188  putative acetyltransferase  31.39 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.340862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0669  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5915  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4337  GCN5-related N-acetyltransferase  38.16 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.473125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  33.57 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0402  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1275  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.65 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2408  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 314 aa  57.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.78 
 
 		 312 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2461  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3784  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.316492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  29.77 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  36.44 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24640  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  35.34 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0300404  normal  0.164851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 		 309 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.48831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  34.26 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  31.33 
 
 		 319 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4712  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.733249  normal  0.303303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  31.33 
 
 		 319 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3870  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.47616 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7207  acetyltransferase  29.47 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0214  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.159498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3318  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.04 
 
 		 322 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>