91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0213 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  87.88 
 
 		 66 aa  121  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  68.18 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  69.7 
 
 		 66 aa  94.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  65.15 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  62.5 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  62.5 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  56.06 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  54.55 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  35.82 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  37.31 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 68 aa  48.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1830  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.99 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.6474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.94 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.49 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1747  ThiS  31.25 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2016  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.509039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.17 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  27.27 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 		 65 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.58 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.12 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  32.81 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1939  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  31.34 
 
 		 327 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  32.35 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3069  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0208668  normal  0.582479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  22.73 
 
 		 66 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 67 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  30.65 
 
 		 64 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 66 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>