More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  100 
 
 		 299 aa  593  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  96.66 
 
 		 299 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  63.61 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  63.61 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  56.21 
 
 		 312 aa  322  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  56.16 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  56.16 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  56.16 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  56.16 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  63.95 
 
 		 319 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  54.32 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  52.9 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  54.11 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  54.11 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  56.27 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  56.27 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  52.88 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  50.71 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  50.99 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  51.21 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  46.44 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  52.08 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  43.11 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  43 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  41.5 
 
 		 305 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 305 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  44.64 
 
 		 305 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  41.81 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  40.8 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  42.62 
 
 		 302 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  41.52 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  41.11 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  39.79 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  41.81 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  43.19 
 
 		 307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.52 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  41.18 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  45.52 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  41.81 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  41.96 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  41.81 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  43.67 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  39.58 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  45.23 
 
 		 306 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  41.3 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  45.88 
 
 		 307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  40 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  42.37 
 
 		 327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  43.62 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  43.36 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  39.81 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 315 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  43.17 
 
 		 327 aa  208  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  41.99 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  38.46 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  41.84 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 298 aa  205  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  40.93 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  45.02 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.84 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  41.86 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.76 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  44.88 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  40 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  40.48 
 
 		 312 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  40.48 
 
 		 312 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  41.05 
 
 		 312 aa  198  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  37.78 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0673  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  38.44 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  39.36 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  38.68 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  42.35 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1830  cation diffusion facilitator family transporter  38.31 
 
 		 320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  39.86 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  40.4 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0425  cation diffusion facilitator family transporter  43.05 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1284  zinc transporter ZitB  42.03 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000026139  hitchhiker  0.00172679 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  39.29 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  38.83 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  40.41 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4666  CDF family cation efflux system protein  41.61 
 
 		 320 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  39.86 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3688  cation diffusion facilitator family transporter  37.89 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0974105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  41 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  38.91 
 
 		 378 aa  189  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  37.02 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0999  cation diffusion facilitator family transporter  39.44 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 		 352 aa  188  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  42.43 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4311  cation diffusion facilitator family transporter  42.66 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  0.413634 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  37.41 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  39.67 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>