118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_03851 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 
210 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  59.62 
 
 
210 aa  267  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  59.13 
 
 
212 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  59.13 
 
 
212 aa  263  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  58.17 
 
 
210 aa  257  8e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  57.21 
 
 
210 aa  254  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  55.29 
 
 
210 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  55.5 
 
 
212 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  51.02 
 
 
239 aa  206  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  51.53 
 
 
217 aa  206  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  50.46 
 
 
221 aa  206  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  52.82 
 
 
220 aa  205  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  47.91 
 
 
216 aa  205  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  51.04 
 
 
191 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  47.74 
 
 
222 aa  197  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  34.21 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  32.69 
 
 
228 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  34.54 
 
 
233 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  31.12 
 
 
229 aa  94.7  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.24 
 
 
313 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  32.04 
 
 
261 aa  90.1  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  29.29 
 
 
284 aa  86.3  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  30.2 
 
 
292 aa  85.9  5e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.86 
 
 
195 aa  82  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  29.7 
 
 
310 aa  81.3  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.35 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.86 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  30.22 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.24 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  27.37 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  27.93 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  29.91 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.33 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  30.11 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  26.32 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  28.28 
 
 
318 aa  75.1  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.48 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  29.56 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.29 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  29.35 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  31.46 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 
250 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  28.49 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  28.49 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  28.49 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  27.86 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  28.28 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  28.02 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  29.82 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.73 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  31.25 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  28.78 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  30.34 
 
 
310 aa  68.6  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.13 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  28.79 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  26.23 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  27.78 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  29.5 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  30.59 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  27.23 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  25.71 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0508  thymidylate synthase complementing protein ThyX  30.77 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.38 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  30.39 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  28.11 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.57 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  27.05 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  27.05 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.27 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.77 
 
 
228 aa  61.6  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.29 
 
 
260 aa  60.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  25.28 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  25.93 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  25.93 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  27.27 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  28.23 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  26.73 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  26.48 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  25.27 
 
 
274 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  29.14 
 
 
282 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.14 
 
 
273 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.14 
 
 
273 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.18 
 
 
241 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  23.23 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  27.71 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  26.18 
 
 
252 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.18 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  26.18 
 
 
257 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  29.17 
 
 
245 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  27.65 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.88 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0273  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25 
 
 
251 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  27.53 
 
 
240 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  27.7 
 
 
233 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.95 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  25.68 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  21.64 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.28 
 
 
281 aa  52.4  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.26 
 
 
273 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.933104 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>