More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2020 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
384 aa  782    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  59.51 
 
 
374 aa  468  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.7 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  50.56 
 
 
404 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  50.28 
 
 
404 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  48.31 
 
 
419 aa  346  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  48.45 
 
 
402 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  48.44 
 
 
376 aa  329  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  46.29 
 
 
398 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  41.94 
 
 
399 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  41.46 
 
 
378 aa  285  8e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  42.98 
 
 
392 aa  282  8.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  41.05 
 
 
390 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  39.22 
 
 
394 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  41.53 
 
 
386 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  41.33 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  41.97 
 
 
386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  39.73 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  40 
 
 
369 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  37.83 
 
 
389 aa  262  8e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1469  extracellular ligand-binding receptor  40.86 
 
 
370 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000103418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  39.36 
 
 
381 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  38.31 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  39.11 
 
 
396 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1676  extracellular ligand-binding receptor  41.33 
 
 
370 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000661006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  41.82 
 
 
370 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  37.47 
 
 
390 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  38.08 
 
 
405 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  37.97 
 
 
397 aa  243  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0265  extracellular ligand-binding receptor  41.76 
 
 
376 aa  242  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000854786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  37.76 
 
 
386 aa  241  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  37.22 
 
 
395 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  37.4 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  39.01 
 
 
384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  35.34 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  37.16 
 
 
381 aa  232  9e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  34.9 
 
 
383 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  36.6 
 
 
383 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  38.46 
 
 
392 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0475  Extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000158967  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  34.29 
 
 
375 aa  219  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2305  extracellular ligand-binding receptor  38.98 
 
 
380 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  37.36 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  36.02 
 
 
376 aa  215  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  31.58 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0610  Extracellular ligand-binding receptor  33.86 
 
 
378 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  34.22 
 
 
391 aa  209  7e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 
372 aa  205  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.42 
 
 
388 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  35.41 
 
 
391 aa  203  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  36.57 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0399  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  34.24 
 
 
372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.08 
 
 
376 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1162  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.23 
 
 
369 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.438916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0770  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.52 
 
 
369 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.132066  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1037  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.23 
 
 
369 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.148346  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.83 
 
 
371 aa  190  4e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  34.09 
 
 
393 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.96 
 
 
395 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0769  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.95 
 
 
371 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0554402  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1110  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.07 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.71 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1038  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.95 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0869251  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1163  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.95 
 
 
371 aa  182  7e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.860982  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.65 
 
 
399 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
388 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 
397 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  34.63 
 
 
382 aa  173  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 
378 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  32.31 
 
 
377 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  32.09 
 
 
388 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  32.02 
 
 
382 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  31.59 
 
 
387 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  35.16 
 
 
399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1695  extracellular ligand-binding receptor  30.93 
 
 
381 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6014  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 
387 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 
401 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
386 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  31.23 
 
 
383 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 
382 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.79 
 
 
395 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  34.23 
 
 
384 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  28.85 
 
 
373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  31.55 
 
 
380 aa  156  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  30.81 
 
 
460 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
401 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  31.92 
 
 
371 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 
814 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
383 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 
383 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  31.47 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  31.9 
 
 
393 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  33.04 
 
 
401 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 
373 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>