More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27566 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27566  predicted protein  100 
 
 
381 aa  771    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298942  normal  0.129514 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  57.39 
 
 
357 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  60.98 
 
 
343 aa  415  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  58.46 
 
 
340 aa  413  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  59.15 
 
 
341 aa  411  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1374  hypothetical protein  60 
 
 
346 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.920044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  58.81 
 
 
342 aa  401  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  57.01 
 
 
332 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.26 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3136  NmrA family protein  48.81 
 
 
337 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  45.95 
 
 
344 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3798  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.76 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387174  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  47.24 
 
 
315 aa  286  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_30690  predicted protein  44.89 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0211111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  31.44 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  28.08 
 
 
297 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.35 
 
 
294 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  29.6 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  29.81 
 
 
292 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.08 
 
 
291 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  28.63 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
290 aa  89.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  29.37 
 
 
321 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.24 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  28.74 
 
 
293 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  28.53 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1312  NmrA family protein  26.33 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  26.62 
 
 
300 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
298 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  26.65 
 
 
294 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 
227 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.19 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  28.94 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1407  NmrA family protein  24.77 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  32.74 
 
 
221 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  23.9 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.1 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.38 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.65 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
219 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.87 
 
 
216 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.39 
 
 
324 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.01 
 
 
324 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  26.14 
 
 
305 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  24.24 
 
 
506 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
270 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.89 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115115  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 
474 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  27.03 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.83 
 
 
320 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
251 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
254 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  23.3 
 
 
320 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  28.57 
 
 
315 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  24.66 
 
 
323 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  24.66 
 
 
323 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  29.41 
 
 
254 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.38 
 
 
320 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
296 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  26.16 
 
 
280 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  25.68 
 
 
250 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  26.05 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  23.93 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.93 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  26.04 
 
 
486 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  29.94 
 
 
695 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  24.69 
 
 
257 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  27.4 
 
 
250 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  26.82 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  26.82 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  25.08 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  23.53 
 
 
311 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  27.63 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  29.28 
 
 
251 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
459 aa  54.3  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  27.04 
 
 
267 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.54 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  32.72 
 
 
276 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2520  hypothetical protein  28.41 
 
 
250 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0728182  normal  0.0134539 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  28.96 
 
 
254 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  22.59 
 
 
320 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 
294 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0386  NADH-ubiquinone oxidoreductase family protein  25.21 
 
 
340 aa  53.1  0.000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>